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J-GLOBAL ID：201902243567683258   整理番号：19A1459594

海底堆積物から分離したPhyllum chloroflexi内のPelolinea submarina MO-CFX1 Tの完全ゲノム配列【JST・京大機械翻訳】

Complete genome sequence of Pelolinea submarina MO-CFX1^T within the phylum Chloroflexi, isolated from subseafloor sediment

著者 (8件)： Nakahara Nozomi (Department of Civil and Environmental Engineering, Nagaoka University of Technology, Nagaoka, Niigata 940-2188, Japan) ,  Nakahara Nozomi (Department of Subsurface Geobiological Analysis and Research (D-SUGAR), Japan Agency for Marine-Earth Science & Technology (JAMSTEC), Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan) ,  Takaki Yoshihiro (Department of Subsurface Geobiological Analysis and Research (D-SUGAR), Japan Agency for Marine-Earth Science & Technology (JAMSTEC), Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan) ,  Takaki Yoshihiro (Ecosystem Observation and Evaluation Methodology Research Unit, Project Team for Development of New-generation Research Protocol for Submarine Resources, JAMSTEC, Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan) ,  Ogawara Miyuki (Department of Subsurface Geobiological Analysis and Research (D-SUGAR), Japan Agency for Marine-Earth Science & Technology (JAMSTEC), Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan) ,  Yamaguchi Takashi (Department of Civil and Environmental Engineering, Nagaoka University of Technology, Nagaoka, Niigata 940-2188, Japan) ,  Takai Ken (Department of Subsurface Geobiological Analysis and Research (D-SUGAR), Japan Agency for Marine-Earth Science & Technology (JAMSTEC), Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan) ,  Imachi Hiroyuki (Department of Subsurface Geobiological Analysis and Research (D-SUGAR), Japan Agency for Marine-Earth Science & Technology (JAMSTEC), Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan)
資料名： Marine Genomics  (Marine Genomics)
巻： 46  ページ： 49-53  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3299A  ISSN： 1874-7787  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Pelolinea submarina株MO-CFX1~T(=JCM17238~T,=KCTC 5975~T)は,北西太平洋,日本のShimokita半島沖で収集した海底堆積物から分離した嫌気性化学有機栄養細菌である。この株は深海堆積環境からの門Chloroに属する最初の分離株であった。ここでは,この株の完全なゲノム配列を報告する。このゲノムは,50.6%のGC含量を有する円形染色体において3,519,887bpから成り,3131の蛋白質コード配列を含んでいた。ゲノムは解糖のためのEmbden-Meyerhorf-Parnas経路に対する完全な遺伝子セットを含み,糖との化学器官栄養増殖能と共役している。以前に報告されている門の他のメンバーのゲノムと同様に,この株のゲノムは,典型的なグラム陰性細菌細胞エンベロープにおいて一般的に観察されるリポ多糖類の産生に関連する蛋白質ファミリーのメンバーと二次特異的外膜の集合を欠いている。この知見は,本株が単はい葉細胞エンベロープを有することを示唆する。得られたゲノムデータは,P.submarina株MO-CFX1~Tの生理学的可能性と細胞エンベロープ特性への洞察を提供し,門Chloroflexiに関する著者らの知識におけるギャップを埋めるのに役立つ。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 従属栄養 ,  タンパク質 ,  北西太平洋 ,  遺伝子 ,  共役 ,  *海底堆積物 ,  *ゲノム ,  染色体 ,  細菌 ,  深海 ,  半島
準シソーラス用語： 緑色非硫黄細菌門 ,  外膜 ,  分離株 ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Pelolinea Submarina ,  Chloroflexi ,  完全ゲノム ,  海底堆積物 ,  細胞エンベロープ

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (3件)： 海底堆積物 ,  Mo ,  ゲノム配列