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J-GLOBAL ID：201902244403265188   整理番号：19A0710925

細胞骨格における細胞進化と静電相互作用機構を明らかにする細胞内ストstoゲノミクス【JST・京大機械翻訳】

Subcellular stoichiogenomics reveal cell evolution and electrostatic interaction mechanisms in cytoskeleton

著者 (9件)： Zhang Yu-Juan (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Zhang Yu-Juan (State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming, People’s Republic of China) ,  Zhu Chengxu (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Ding Yiran (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Yan Zheng-Wen (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Li Gong-Hua (State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming, People’s Republic of China) ,  Lan Yang (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Wen Jian-Fan (State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming, People’s Republic of China) ,  Chen Bin (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University, Chongqing, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 469  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 真核細胞は膨大な種類の内部的に特殊化された細胞内コンパートメントを含む。生物学的巨大分子における元素利用のパターンを明らかにすることを目的とした。しかしながら,化学量論的特性とそれらが種々の細胞内微小環境にどのように適応するかはまだ不明である。ここでは,まず,化学量論の定義を更新した。次に,それを細胞内研究に適用し,細胞外プロテオームの核および水素,硫黄含有量の明確な窒素含有量を検出した。特に,細胞骨格蛋白質の酸性アミノ酸(AAs)含量が最も高いことを見出した。荷電AAsの増加は主に真核生物由来細胞骨格蛋白質により引き起こされた。細胞骨格の機能的細分化は,活性化,結合/会合および複合体が3つの最大の機能的カテゴリーであることを示した。静電相互作用分析は,細胞骨格における3D構造の一次配列とPPI界面の間の静電相互作用の増加を示した。本研究は細胞内化学量論的特性のブループリントを作成し,細胞骨格の荷電AAsが進化において大きく増加することを説明し,真核細胞骨格蛋白質に対する材料基盤を静電相互作用の2つの方法で作用させ,さらにそれらの活性化,結合/会合及び複合体形成を行った。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  プロテオーム ,  *静電相互作用 ,  化学量論 ,  電荷 ,  水素 ,  *細胞骨格 ,  真核細胞 ,  硫黄 ,  三次元 ,  真核生物 ,  界面 ,  複合体
準シソーラス用語： 巨大分子 ,  *ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： stoicゲノミクス ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノミクス ,  要素 ,  電荷アミノ酸

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (43件)：

• Biology; 2008; CR1; NA Campbell, JB Reece, LA Urry, ML Cain, SA Wasserman, PV Minorsky, RB Jackson; citation_publisher=Pearson Education
• Protein Sci; Sequence conserved for subcellular localization; R Nair, B Rost; 11; 12; 2002; 2836-2847; 10.1110/ps.0207402; citation_id=CR2
• Genome Biol; Functional diversification of duplicate genes through subcellular adaptation of encoded proteins; AC Marques, N Vinckenbosch, D Brawand, H Kaessmann; 9; 3; 2008; R54; 10.1186/gb-2008-9-3-r54; citation_id=CR3
• Trends Ecol Evol; Protein subcellular relocalization: a new perspective on the origin of novel genes; SA Byun-McKay, R Geeta; 22; 7; 2007; 338-344; 10.1016/j.tree.2007.05.002; citation_id=CR4
• Mol Biol Evol; Protein evolution is faster outside the cell; K Julenius, AG Pedersen; 23; 11; 2006; 2039-2048; 10.1093/molbev/msl081; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： 細胞骨格 ,  細胞 ,  進化 ,  静電相互作用 ,  スト ,  STO ,  ゲノミクス