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J-GLOBAL ID：201902244715381640   整理番号：19A0660136

酵素反応のQM/MM研究におけるMM分極の重要性:QM/MM Drude振動子モデルの評価【JST・京大機械翻訳】

Importance of MM Polarization in QM/MM Studies of Enzymatic Reactions: Assessment of the QM/MM Drude Oscillator Model

著者 (3件)： Ganguly Abir (Max-Planck-Institut fuer Kohlenforschung, Germany) ,  Boulanger Eliot (Max-Planck-Institut fuer Kohlenforschung, Germany) ,  Thiel Walter (Max-Planck-Institut fuer Kohlenforschung, Germany)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 6  ページ： 2954-2961  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 酵素反応の正確な量子力学/分子力学(QM/MM)研究のために,例えばDrude振動子(DO)モデルを用いることによって,MM分極を含むことが望ましい。長い間,そのような研究は,蛋白質に対する良く試験された分極力場の欠如により妨げられた。最近の予備的QM/MM-DO評価(J.Chem)に従った。ここでは,QM/CHARMM-DOモデルと2つのQM法(B3LYP,OM2)を用いて,2つの酵素反応に及ぼすMM分極の影響を包括的に調べた。QM/MM-DOレベルでの広範な幾何学的最適化と自由エネルギーシミュレーションからの結果を,従来のQM/MMレベルでの類似計算から得られたものと比較した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  *酵素反応 ,  *モデル ,  量子論 ,  シミュレーション ,  自由エネルギー ,  タンパク質 ,  分子内力学 ,  力の場 ,  *振動子 ,  *分極
準シソーラス用語： 幾何学的最適化 ,  B3LYP法 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子の電子構造  (BH05010Q) ,  分子の電気的・磁気的性質  (BH05032U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 酵素反応 ,  研究 ,  分極 ,  重要性 ,  振動子 ,  モデル ,  評価