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J-GLOBAL ID：201902246126645513   整理番号：19A1100862

全ゲノム深配列決定によるヒトヘルペスウイルス6Aの組織培養適応の分析は参照配列を再定義しウイルス侵入複合体変化を同定する【JST・京大機械翻訳】

Analyses of Tissue Culture Adaptation of Human Herpesvirus-6A by Whole Genome Deep Sequencing Redefines the Reference Sequence and Identifies Virus Entry Complex Changes

著者 (5件)： Tweedy Joshua G. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene & Tropical Medicine, University of London, London WC1E 7HT, UK) ,  Escriva Eric (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene & Tropical Medicine, University of London, London WC1E 7HT, UK) ,  Escriva Eric (Institute for Structural and Molecular Biology, Department Biology, Birkbeck College University of London, London WC1E 7HX, UK) ,  Topf Maya (Institute for Structural and Molecular Biology, Department Biology, Birkbeck College University of London, London WC1E 7HX, UK) ,  Gompels Ursula A. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene & Tropical Medicine, University of London, London WC1E 7HT, UK)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 16  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウイルスの組織培養適応は感染を調節できる。ヒトサイトメガロウイルス(HCMV)の実験室通過と細菌人工染色体(BAC)中央クローン化は,ゲノム欠失とウイルス侵入複合体をコードする遺伝子を変化させる再編成をもたらし,細胞指向性,病原性,およびワクチン発生に影響を及ぼした。ここでは,関連するベータヘルペスウイルス,Roseolovirus,ヒトヘルペスウイルス6A(HHV-6A)株U1102に対する参照ゲノムに対するこれらの影響を分析した。このウイルスは,ヒト個体群の約1%で生殖系列サブテロメア染色体統合により自然にクローン化され,正確な参照は外因性と内因性ウイルスの間の病理学的関係を理解するための鍵である。全ゲノム次世代深配列化Illinaに基づく方法を用いて,著者らは元の分離株を組織培養継代培養およびBACE中央クローン化ウイルスと比較した。これは,32の補正と5つの多型を示す参照ゲノムを再定義した。さらに,継代およびバクミウイルスのわずかな変異体分析により,10の遺伝子座においてさらに32個の一塩基多型(SNP)の出現個体群を同定し,細胞培養選択を示す半同義性を示した。BACウイルスゲノムの分析は,緑色蛍光蛋白質(GFP)に基づく選択を除去するloxP組換えによるBACカセットの欠失を示した。HCMV培養効果について示されたように,ウイルスエンベロープ糖蛋白質遺伝子gBおよびgH/gL複合体を含むウイルス細胞侵入のメディエーターをコードする遺伝子にマッピングされたHHV-6A SNPを選択した。比較モデルは融合後立体配座の安定化を示唆した。これらのSNPはワクチン設計,抗微生物薬耐性および病因において考慮するために不可欠である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 継代培養 ,  *ゲノム ,  遺伝子 ,  *培養 ,  ワクチン ,  クローン ,  立体配座 ,  *ヒト ,  糖タンパク質 ,  *複合体 ,  染色体 ,  病原性 ,  病因 ,  *組織培養
準シソーラス用語： ウイルスゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (12件)： ヒトヘルペスウイルス ,  HHV-6 ,  HHV-6A ,  Roseolovirus ,  βヘルペスウイルス ,  ウイルス侵入複合体 ,  GH/GL ,  GB ,  ディープシークエンシング ,  参照ゲノム ,  細胞融合 ,  糖蛋白質構造モデル

分類 (3件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  ウイルス学一般  (EG04010J) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

引用文献 (55件)：

• Chee, M.S.; Bankier, A.T.; Beck, S.; Bohni, R.; Brown, C.M.; Cerny, R.; Horsnell, T.; Hutchison, C.A., 3rd; Kouzarides, T.; Martignetti, J.A.; et al. Analysis of the protein-coding content of the sequence of human cytomegalovirus strain AD169. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1990, 154, 125-169.
• Cha, T.A.; Tom, E.; Kemble, G.W.; Duke, G.M.; Mocarski, E.S.; Spaete, R.R. Human cytomegalovirus clinical isolates carry at least 19 genes not found in laboratory strains. J. Virol. 1996, 70, 78-83.
• Ciferri, C.; Chandramouli, S.; Donnarumma, D.; Nikitin, P.A.; Cianfrocco, M.A.; Gerrein, R.; Feire, A.L.; Barnett, S.W.; Lilja, A.E.; Rappuoli, R.; et al. Structural and biochemical studies of HCMV gH/gL/gO and Pentamer reveal mutually exclusive cell entry complexes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2015, 112, 1767-1772.
• Murrell, I.; Wilkie, G.S.; Davison, A.J.; Statkute, E.; Fielding, C.A.; Tomasec, P.; Wilkinson, G.W.; Stanton, R.J. Genetic Stability of Bacterial Artificial Chromosome-Derived Human Cytomegalovirus during Culture In Vitro. J. Virol. 2016, 90, 3929-3943.
• Ciferri, C.; Chandramouli, S.; Leitner, A.; Donnarumma, D.; Cianfrocco, M.A.; Gerrein, R.; Friedrich, K.; Aggarwal, Y.; Palladino, G.; Aebersold, R.; et al. Antigenic Characterization of the HCMV gH/gL/gO and Pentamer Cell Entry Complexes Reveals Binding Sites for Potently Neutralizing Human Antibodies. PLoS Pathog. 2015, 11, e1005230.

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  組織培養 ,  適応 ,  分析 ,  参照 ,  ウイルス侵入 ,  複合体 ,  同定