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J-GLOBAL ID：201902246709768822   整理番号：19A1638736

ゲノム情報によるBradyrhizobium分類学:ここからどこへ?【JST・京大機械翻訳】

Genome-informed Bradyrhizobium taxonomy: where to from here?

著者 (14件)： Avontuur Juanita R. (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Palmer Marike (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Beukes Chrizelle W. (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Chan Wai Y. (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Chan Wai Y. (Biotechnology Platform, Agricultural Research Council Onderstepoort Veterinary Institute (ARC-OVI), Onderstepoort 0110, South Africa) ,  Coetzee Martin P.A. (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Blom Jochen (Bioinformatics and Systems Biology, Justus-Liebig-University Giessen, Giessen, Germany) ,  Stepkowski Tomasz (Autonomous Department of Microbial Biology, Faculty of Agriculture and Biology, Warsaw University of Life Sciences (SGGW), Poland) ,  Kyrpides Nikos C. (DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, United States) ,  Woyke Tanja (DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, United States) ,  Shapiro Nicole (DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, United States) ,  Whitman William B. (Department of Microbiology, University of Georgia, Athens, GA, United States) ,  Venter Stephanus N. (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa) ,  Steenkamp Emma T. (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa)
資料名： Systematic and Applied Microbiology  (Systematic and Applied Microbiology)
巻： 42  号： 4  ページ： 427-439  発行年： 2019年 
JST資料番号： W0168A  ISSN： 0723-2020  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Bradyrhizobiumは最大で最も多様な根粒属であると考えられているが,これは記載された種の数に反映されていない。それは認識された最初の根粒属の1つであったが,その分類は複雑である。種々の現代の研究は,ゲノム配列情報が分類学的決定を単純化する可能性を示している。したがって,Bradyrhizobiumに対するゲノムの成長可能性は,新種の描写と特性化に役立つ可能性がある。本研究では,2つの目的に取り組んだ:最初に,Bradyrhizobiumに対する利用可能なゲノム資源の利用可能性と品質をレビューした。これはゲノム配列を用いてゲノム配列を比較し,ゲノムに基づく系統発生分析における封入体の完全性のレベルを推定することにより達成された。第二に,これらのゲノムを利用して,その多様な生活様式に照らしてBradyrhizobiumの分類学的な立場を調べた。ゲノム配列はそれらの品質と完全性の点で異なっていたが,我々のデータはこれらのゲノム配列の利用が分類学的目的に適していることを示している。これらの資源を用いることにより,完全に解決された良く支持された系統発生を推論した。それはBradyrhizobiumを7つの系統に分離し,その3つは属について知られているいわゆるスーパーグループに対応した。根粒形成,窒素固定および光合成のような重要なライフスタイル特性の広い分布は,これらの形質が複雑な進化史を有することを明らかにした。著者らは,細菌のこの重要な集合の進化を研究するためのゲノム配列情報に基づく最初のロバストなBradyrhizobium種系統発生を提示する。さらに,本研究は,特に種と属レベルで重要な分類学的決定をするための資源としてゲノム配列情報を用いるための基礎を提供する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ロバスト性 ,  根粒 ,  窒素固定 ,  系統発生 ,  新種 ,  キャラクタリゼーション ,  光合成 ,  *ゲノム ,  品質 ,  完全性 ,  系統解析 ,  ゲノム配列 ,  *分類学 ,  *ブラディリゾビウム属 ,  *リゾビウム科
準シソーラス用語： *Bradyrhizobium , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 系統ゲノミクス ,  Bradyrhizobium japonicum ,  Bradyrhizobium elkanii ,  光合成Bradyrhizobium ,  根粒形成 ,  光合成

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： ゲノム情報 ,  Bradyrhizobium ,  分類学