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J-GLOBAL ID：201902247461001958   整理番号：19A1848219

胃癌におけるEXD3遺伝子の発現と機能のバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of expression and function of EXD3 gene in gastric cancer

著者 (4件)： Sun Dengzhong (蚌埠医学院第一附属医院胃腸外科,安徽 蚌埠,233003) ,  Liu Mulin (蚌埠医学院第一附属医院胃腸外科,安徽 蚌埠,233003) ,  Wu Huazhang (蚌埠医学院生物科学系,安徽 蚌埠,233003) ,  Huang Fuxin (蚌埠医学院生物科学系,安徽 蚌埠,233003)
資料名： Nanfang Yike Daxue Xuebao  (Nanfang Yike Daxue Xuebao)
巻： 39  号： 2  ページ： 215-221  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2216A  ISSN： 1673-4254  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:バイオインフォマティクス分析を通じて胃癌と正常胃粘膜の間に差次的発現を持つ遺伝子を研究し、胃癌の発生発展及び予後に関与する重要な遺伝子を見つけ、それに関連する機能について分析予測を行う。【方法】GSE100935(18例の胃癌サンプルと正常な胃粘膜組織を含む)をGEO発現スペクトルデータベースからダウンロードし,遺伝子チップGSE100935のデータをMorpheusソフトウェアで分析した。胃癌と正常な胃粘膜組織に差次的に発現する遺伝子を得て、クラスター分析熱図を構築した。ソフトウェアUALCANを用いて、胃癌と正常胃粘膜組織における発現遺伝子の発現をオンライン分析した。Kaplan-Meierプロットソフトウェアを用いて,胃癌患者における差次的発現遺伝子の発現を,分析した。最後に、FunRichソフトを用いてGO機能濃縮分析を行い、ウェブサイトSTRINGは目的遺伝子タンパク質相互作用ネットワークを構築した。【結果】遺伝子チップGSE100935を用いて,45119個の差次的発現遺伝子を得た。オンライン分析ソフトウェアUALCANは,EXD3遺伝子が胃癌組織で過剰発現することを示した。同時に、生存分析はEXD3遺伝子が高発現された時、胃癌患者の予後が比較的悪いことを示した。GO機能濃縮分析により、差次的発現遺伝子は主に胃癌細胞ヌクレオチドの新陳代謝調節及び転写因子の活動と関係があることが分かった。結論:EXD3は胃癌における潜在的な癌遺伝子であり、DNA損傷の修復と関係がある可能性があり、その発現のアップレギュレーションは胃癌の発生発展と予後の過程に重要な作用を発揮し、胃癌患者の予後を判断する重要な生物学的指標となる可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ソフトウェア ,  *遺伝子 ,  転写因子 ,  代謝 ,  ヌクレオチド ,  ヒト ,  *胃腫瘍 ,  癌遺伝子 ,  胃粘膜 ,  予測 ,  ネットワーク ,  予後 ,  アップレギュレーション
準シソーラス用語： 過剰発現 ,  差次的遺伝子発現 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： EXD3 ,  gastric cancer ,  bioinformatics analysis ,  prognosis

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 胃癌 ,  遺伝子 ,  発現 ,  バイオインフォマティクス ,  分析