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J-GLOBAL ID：201902247568663470   整理番号：19A1884753

MDシミュレーションと3D-RISM-KH理論による2-ヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリンのコレステロールへの結合モードの予測【JST・京大機械翻訳】

Predicting the Binding Mode of 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin to Cholesterol by Means of the MD Simulation and the 3D-RISM-KH Theory

著者 (6件)： Hayashino Yuji (Ritsumeikan University, College of Life Science, Department of Bioinformatics, Shiga, Japan) ,  Sugita Masatake (Ritsumeikan University, College of Life Science, Department of Bioinformatics, Shiga, Japan) ,  Arima Hidetoshi (Department of Physical Pharmaceutics, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kumamoto University) ,  Irie Tetsumi (Department of Clinical Chemistry and Informatics, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kumamoto University) ,  Kikuchi Takeshi (Ritsumeikan University, College of Life Science, Department of Bioinformatics, Shiga, Japan) ,  Hirata Fumio (Toyota Physical and Chemical Research Institute, Aichi, Japan)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 122  号： 21  ページ： 5716-5725  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： シクロデキストリン誘導体,2-ヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリン(HPβCD)は,Niemann-Pick病型Cに対し合理的な治療効果を有し,これはリソソームにおける非エステル化コレステロールおよび糖脂質の異常蓄積および他の細胞コンパートメントにおけるエステル化コレステロールの不足により生じることが見出されている。リソソームからコレステロールを除去するためのHPβCDの可能な機構を解明するために,コレステロールとHPβCDの結合親和性とモードを研究した。コレステロールによるHPβCDの支配的結合モードを,分子動力学シミュレーションと液体の統計力学理論,またはKovalenko-Hirata閉鎖関係を有する三次元参照相互作用部位モデル理論に基づいて見出した。HPβCDとコレステロール,すなわち1対1(1:1)と2対1(2:1)の間の2種類の複合体を調べた。1:1錯体は溶液中で2つまたは3つのタイプの安定結合モードを作り,βCD環がステロイド骨格の端に位置する傾向があると予測した。2:1複合体に対して,2つのHPβCDsの間の配向に依存して,4つの異なるタイプの複合体が存在する:頭-頭(HH),頭尾(HT),尾部-頭(TH),尾部-尾(TT)。HTおよびHHシクロデキストリン二量体は,他の二量体と比較してコレステロールに対して高い親和性を示し,1:1複合体の全ての結合様式に対して高い親和性を示した。HTとHH二量体が他の錯体と比較して高い親和性を有する物理的理由を,1:1錯体との整合性に基づいて議論した。一方,HTとHH二量体の場合には,コレステロール鎖に沿った二量体中の各CDの位置は,単一CDが安定な錯体を作る位置の1つに近いかまたは近くにある。一方,CD分子の一つは,THおよびTT二量体の場合に,コレステロール鎖に沿った不安定領域に位置していた。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： リソソーム ,  *三次元 ,  二量体 ,  *シクロデキストリン ,  親和性 ,  糖脂質 ,  コレステロールエステル ,  錯体 ,  計算機シミュレーション ,  複合体 ,  ステロール ,  脂環式アルコール
準シソーラス用語： 作用部位 ,  分子動力学シミュレーション ,  結合親和性 ,  *結合モード , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  薬物の物理化学的性質  (GV01060M)

物質索引 (2件)： コレステロール ,  2-ヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリン

タイトルに関連する用語 (8件)： MDシミュレーション ,  3D ,  KH ,  理論 ,  2-ヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリン ,  コレステロール ,  結合モード ,  予測