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J-GLOBAL ID:201902248304463559   整理番号:19A1804157

反応性代謝産物蛋白質付加物の非標的同定【JST・京大機械翻訳】

Nontargeted Identification of Reactive Metabolite Protein Adducts
著者 (3件):
資料名:
巻: 89  号: 11  ページ: 5748-5756  発行年: 2017年 
JST資料番号: A0395A  ISSN: 0003-2700  CODEN: ANCHAM  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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多くの異なる化学物質の代謝生物活性化は,高分子標的(例えば,蛋白質またはDNA)への結合を介して毒性に導く高反応性化合物(化学反応性代謝産物,CRMs)の形成をもたらす。CRMsの蛋白質標的とそれらの修飾部位の同一性を決定するために,ロバストで迅速な非標的分析技術を開発する必要がある。ここでは,前情報なしで単一実験において反応性代謝産物により修飾された蛋白質標的と同様に,投与化合物から形成されたCRMの同一性を決定することができる非標的化方法論を紹介する。アセトアミノフェン(N-アセチル-p-アミノフェノール,APAP)および13C_6-APAPをラット肝ミクロソームとインキュベートし,反応性代謝産物N-アセチル-p-ベンゾキノンイミン(NAPQI)にAPAPを生物活性化することが知られている。液体クロマトグラフィー/質量分析(LC/MS)分析に続く全体的トリプシン消化を用いて,NAPQIによって付加されたペプチドの「ツイン」イオンピークおよびタンデム質量分析(MS/MS)によるショットガンプロテオミクスを位置付けた。Xenophileと呼ばれる混合データ分析ソフトウェアの開発により,付加されたアミノ酸残基の同一性を確立することができ,蛋白質データベース検索アルゴリズムの特異的パラメータ化の必要性を排除した。実験計画とデータ解析ソフトウェアの組合せにより,CRM,蛋白質標的,及び実験データから直接的に迅速に確立されるように修飾されたアミノ酸残基の同一性を可能にした。Xenはhttps://github.com/mgleeming/Xenophileから自由に利用できる。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (5件):
分類
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蛋白質・ペプチド一般  ,  分光分析  ,  生物学的機能  ,  酵素一般  ,  バイオアッセイ 
タイトルに関連する用語 (5件):
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