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J-GLOBAL ID：201902248904299235   整理番号：19A1899270

NDM-5を生産する中国からのMorgorgan morganii分離株の検出とゲノム特性化【JST・京大機械翻訳】

Detection and Genomic Characterization of a Morganella morganii Isolate From China That Produces NDM-5

著者 (12件)： Guo Xiaobing (Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  Rao Yuting (Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  Rao Yuting (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Guo Lihua (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Xu Hao (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Lv Tao (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Yu Xiao (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Chen Yunbo (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Liu Na (Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  Han Huiming (Basic Medical College, Beihua University, Jilin City, China) ,  Han Huiming (The Clinical Immunology Research Center, Beihua University, Jilin City, China) ,  Zheng Beiwen (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 1156  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： カルバペネム耐性遺伝子bla_NDM-5の増加する罹患率と伝達は,公衆衛生に対する深刻な脅威をもたらした。これまで,bla_NDM-5は,様々な都市にわたって様々な種の腸内細菌および異なる宿主において広く検出されている。しかしながら,bla_NDM-5を持つMorganella morganiiに関する報告はない。2016年1月に,中国における肝臓癌の再発と診断された患者の糞便試料において,最初のNDM-5産生Morganella morganii L241が見出された。16S rRNA遺伝子配列決定を用いて種の同定を行った。カルバペネム遺伝子をPCRと配列決定の両方により同定した。bla_NDM-5を有する臨床分離株の特性と完全なゲノム配列を調査するために,抗菌感受性試験,S1ヌクレアーゼパルス電場ゲル電気泳動,サザンブロット,トランス抱合実験,完全なゲノム配列決定,および比較ゲノム解析を実施した。M.morganii L241は広いスペクトルのセファロスポリンとカルバペネムに耐性であることが分かった。L241の完全なゲノムは,bla_NDM-5(ΔIS3000-ΔISAba125-IS5-bla_NDM-5-trpF-dsbC-IS26)の保存された遺伝的文脈を共有した,3,850,444bpの円形染色体と46,161bpの自己伝染性IncX3プラスミドから構成された。BLASTn分析は,bla_NDM遺伝子を持つIncX3プラスミドが世界中の13の異なる国からの腸内細菌の中で15種で見出されていることを示した。さらに,比較ゲノム解析により,M.morganii L241はM.morganii subsp.morganii KTと107SNPと密接な関係を示すことを示した。著者らの研究は,IncX3が様々な種の間のbla_NDM-_5の世界的な普及における重要な要素であることを示した。このようなプラスミドの広がりを制御し,防ぐためにはさらなる研究が必要である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *キャラクタリゼーション ,  セファロスポリン類 ,  *ゲノム ,  サザンブロット法 ,  公衆衛生 ,  プラスミド ,  ゲル電気泳動 ,  ヒト ,  遺伝子 ,  遺伝 ,  感受性試験 ,  カルボン酸 ,  ラクタム
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  Morganella morganii ,  腸内細菌 ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： BLA_NDM-5 ,  IncX3 ,  Morgorgan morganii ,  完全ゲノム配列 ,  比較ゲノム解析

分類 (2件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： カルバペネム

引用文献 (52件)：

• Ahmad N., Ali S. M., Khan A. U. (2018). Detection of New Delhi metallo-beta-lactamase variants NDM-4, NDM-5, and NDM-7 in Enterobacter aerogenes isolated from a neonatal intensive care unit of a north india hospital: a first report. Microb. Drug Resist. 24 161-165. doi: 10.1089/mdr.2017.0038
• Alikhan N. F., Petty N. K., Ben Zakour N. L., Beatson S. A. (2011). BLAST ring image generator (BRIG): simple prokaryote genome comparisons. BMC Genomics 12:402. doi: 10.1186/1471-2164-12-402
• Aziz R. K., Bartels D., Best A. A., Dejongh M., Disz T., Edwards R. A., et al (2008). The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology. BMC Genomics 9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75
• Bitar I., Dagher C., Salloum T., Araj G., Tokajian S. (2018). First report of an Escherichia coli from Lebanon carrying an OXA-181 carbapenemase resistance determinant. J. Glob. Antimicrob. Resist. 12 113-114. doi: 10.1016/j.jgar.2018.01.002
• Cerdeira L. T., Cunha M. P. V., Francisco G. R., Bueno M. F. C., Araujo B. F., Ribas R. M., et al (2017). IncX3 plasmid harboring a non-Tn4401 genetic element (NTEKPC) in a hospital-associated clone of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae ST340/CG258. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 89 164-167. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2017.06.022

タイトルに関連する用語 (5件)： NDM ,  中国 ,  分離株 ,  ゲノム ,  特性化