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J-GLOBAL ID：201902249201573375   整理番号：19A1650187

比較ゲノム解析は中国における即席食品から分離された腸炎ビブリオの潜在的リスクを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomic Analysis Reveals the Potential Risk of Vibrio parahaemolyticus Isolated From Ready-To-Eat Foods in China

著者 (14件)： Pang Rui (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Xie Tengfei (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Wu Qingping (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Li Yanping (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Lei Tao (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Zhang Jumei (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Ding Yu (Department of Food Science and Technology, Jinan University, Guangzhou, China) ,  Wang Juan (College of Food Science, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Xue Liang (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Chen Moutong (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Wei Xianhu (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Zhang Youxiong (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Zhang Shuhong (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China) ,  Yang Xiaojuan (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 186  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腸炎ビブリオは水産物の消費に関連する主要な食品媒介病原体である。即席食品(RTE)食品におけるこの細菌の存在は最近報告されている。しかし,RTE食品から分離された腸炎ビブリオのゲノム特徴と潜在的リスクはほとんど理解されていない。RTE食品分離株の全ゲノム特性の理解を助けるために,27RTE食品分離株の完全ゲノムを配列決定し,比較ゲノミクスアプローチを用いて20の臨床及び19の他の環境(例えば水及び水生産物源)分離株と比較した。分析により,腸炎ビブリオRTE食品分離株は,平均的に高い数の遺伝子を有し,他の供給源からの分離株より多くの付属遺伝子を有することを明らかにした。ほとんどのRTE食品分離株はいくつかの既知の病原性関連遺伝子および病原性島(PAI)に対して陽性であり,これらの分離株のいくつかは臨床分離株と遺伝的に相同であった。全ゲノム関連分析は79のアクセサリー遺伝子を明らかにし,11の蛋白質コード遺伝子に影響を及ぼす78のミスセンス単一ヌクレオチド多型がRTE食物源と有意に関連していた。これらの遺伝子は,COGデータベースにおける機能的アノテーションに従って,防御機構およびエネルギー生産および変換にほとんど関与していた。KEGG Pathway分析は,これらの遺伝子が腸炎ビブリオの生物膜形成に主に影響することを示し,その後の実験はほとんど全てのRTE食品分離株が生物膜を形成する能力を有することを確認した。バイオフィルム形成はRTE食品における腸炎ビブリオの持続性を促進し,病原性関連遺伝子の存在はヒトへの病原性の可能性をもたらす。著者らの知見は,中国RTE食品における腸炎ビブリオの潜在的リスクを強調し,これらの分離株の持続性に対するゲノム基盤を説明する。この研究は,この細菌により与えられる食品安全性脅威の再評価を助ける。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物膜 ,  ヒト ,  一塩基多型 ,  *腸炎ビブリオ ,  病原性 ,  データベース ,  タンパク質 ,  *食品 ,  *ゲノム ,  *即席食品 ,  遺伝 ,  遺伝子
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  持続性 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 腸炎ビブリオ ,  即席食品 ,  ゲノミクス ,  潜在的リスク ,  バイオフィルム

分類 (3件)： 食品の汚染  (FJ01053P) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  微生物検査法  (EG02020G)

引用文献 (57件)：

• Bankevich A., Nurk S., Antipov D., Gurevich A. A., Dvorkin M., Kulikov A. S., et al. (2012). SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J. Comput. Biol. 19, 455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021
• Broberg C. A., Calder T. J., Orth K. (2011). Vibrio parahaemolyticus cell biology and pathogenicity determinants. Microbes Infect. 13, 992-1001. doi: 10.1016/j.micinf.2011.06.013
• Bruen T. C., Philippe H., Bryant D. (2006). A simple and robust statistical test for detecting the presence of recombination. Genetics 172, 2665-2681. doi: 10.1534/genetics.105.048975
• Brynildsrud O., Bohlin J., Scheffer L., Eldholm V. (2016). Rapid scoring of genes in microbial pan-genome-wide association studies with Scoary. Genome Biol. 17:238. doi: 10.1186/s13059-016-1108-8
• Ceccarelli D., Hasan N. A., Huq A., Colwell R. R. (2013). Distribution and dynamics of epidemic and pandemic Vibrio parahaemolyticus virulence factors. Front. Cell Infect. Microbiol. 3:97. doi: 10.3389/fcimb.2013.00097

タイトルに関連する用語 (6件)： 比較ゲノム ,  解析 ,  中国 ,  即席食品 ,  腸炎ビブリオ ,  リスク