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J-GLOBAL ID：201902249333959469   整理番号：19A1670290

RNA-Seq技術に基づくブタ筋線維性状に影響する候補遺伝子をスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

Screening of Candidate Genes for Muscle Fiber Characteristics in Pig Using RNA-Seq

著者 (11件)： Cheng Zhimin (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Zhang Ningfang (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Wang Yuanyuan (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Le Baoyu (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Zhang Wanfeng (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Song Pengkang (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Guo Xiaohong (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Gao Pengfei (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Cai Chunbo (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Cao Guoqing (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Li Bugao (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 50  号： 5  ページ： 918-929  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 筋繊維性状に影響する候補遺伝子とシグナル経路を検討することを目的とした。本研究では、馬身豚と大白豚を研究対象とし、HE染色法を用い、6カ月齢の馬身豚と大白豚の背最長筋筋線維の直径と密度を分析し、RNA-Seqを用いて、馬身豚と大白豚の背最長筋組織中の遺伝子発現状況を分析した。差次的発現遺伝子をGOとKEGGで濃縮し,qRT-PCRによりRNA-Seq結果の精度を検証した。結果は,ブタの背最長筋線維の直径が,白いブタのそれより著しく低く(P<0.01),筋線維の密度は,白いブタのものより著しく高いことを示した(P<0.01)。トランスクリプトームシークエンシングの結果、6カ月齢の馬身豚と大白豚の背最長筋において、差異倍数が2倍以上の遺伝子は105個で、そのうち、馬身豚は大白豚のアップレギュレーションした遺伝子に対して55個、ダウンレギュレーションした遺伝子は50個あった。GO濃縮分析により、差次的発現遺伝子は主にミトコンドリアに関連する細胞成分と骨格筋分化に関連する生物学的過程に集中しており、KEGG分析結果により、これらの差次的発現遺伝子は酸化的リン酸化に関連する信号経路に参与することが明らかになった。qRT-PCRとRNA-Seqによる6つのDEGsの発現状況に対する測定結果は、それらの発現傾向が同じであり、RNA-Seq結果が正確で信頼できることを表明した。MYL3,MYH6遺伝子は筋線維の組成に影響し,筋線維特性に影響するが,ND6遺伝子はミトコンドリアの酸化的リン酸化過程に関与し,筋線維の型に影響することを,本研究が示した;。MICU2遺伝子はミトコンドリアのCa2+濃度の安定的な影響を通じて細胞機能に影響し、転写因子のEGR1とFOS遺伝子は細胞増殖、分化とアポトーシスなどの過程を調節することによって筋肉の成長発育に影響する。本研究は、馬身豚と大白豚の筋繊維性状の差異を引き起こす主な原因を明らかにし、豚肉の品質の改善に相応する理論的根拠を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アポトーシス ,  *筋線維 ,  細胞増殖 ,  遺伝子発現 ,  転写因子 ,  品質 ,  *RNA【核酸】 ,  ダウンレギュレーション ,  背最長筋 ,  トランスクリプトーム ,  アップレギュレーション ,  *遺伝子 ,  ミトコンドリア
準シソーラス用語： 差次的遺伝子発現 ,  *候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ブタ ,  筋線維 ,  性状 ,  候補遺伝子 ,  スクリーニング