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J-GLOBAL ID：201902249380785899   整理番号：19A1790048

ジャガイモ疫病病原菌Phytophthora infectansの集団ゲノミクスはクローン性と高遺伝子型多様性の両方を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Population genomics of an outbreak of the potato late blight pathogen, Phytophthora infestans, reveals both clonality and high genotypic diversity

著者 (8件)： Maurice Sundy (Section for Genetics and Evolutionary Biology, Department of Biosciences, University of Oslo, Blindernveien 31, Oslo, 0316, Norway) ,  Montes Melanie S. (Department of Biology, University of Copenhagen, Universitetsparken 15, Copenhagen O, 2100, Denmark) ,  Nielsen Bent J. (Department of Agroecology, Aarhus University, Forsogsvej 1, Slagelse, 4200, Denmark) ,  Bodker Lars (Danish Centre for Food and Agriculture, Aarhus University, Blichers Alle 20, Tjele, 8830, Denmark) ,  Martin Michael D. (Centre for Geogenetics, Natural History Museum of Denmark, Solvgade 83, Copenhagen-K, 1307, Denmark) ,  Jonck Carina G. (Department of Biology, University of Copenhagen, Universitetsparken 15, Copenhagen O, 2100, Denmark) ,  Kjoller Rasmus (Department of Biology, University of Copenhagen, Universitetsparken 15, Copenhagen O, 2100, Denmark) ,  Rosendahl Soren (Department of Biology, University of Copenhagen, Universitetsparken 15, Copenhagen O, 2100, Denmark)
資料名： Molecular Plant Pathology  (Molecular Plant Pathology)
巻： 20  号： 8  ページ： 1134-1146  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2688A  ISSN： 1464-6722  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： デンマークにおけるジャガイモ疫病病原体Phytophthora infestansの発生を,個体群構造を解明するために特性化し,どの程度性生殖が起こっているかを決定した。制限部位関連DNA配列決定(RAD-Seq)を用いて生成したマイクロサテライト単純配列反復(SSR)と単一ヌクレオチド多型(SNP)マーカーの標準セットを並行して用いた。2014年に7つの異なるジャガイモ畑から分離された合計83の個体を,5つのデンマークの全ゲノム配列決定分離株とともに分析し,2つのメキシコの個体を外グループとして用いた。55288のSNPの濾過データセットから,集団ゲノミクス分析は組換えの徴候を示さず,クローン性を意味した。これにもかかわらず,多座遺伝子型は個々のジャガイモ圃場に特有であり,圃場間の遺伝子流動の証拠はほとんどなかった。SNPデータセットで行った倍数性分析は,大部分の分離株が二倍体であることを示した。クローン性と高い遺伝子型多様性を伴うこれらの矛盾した結果は,稀な性イベントが個体群にまだ寄与している可能性があることを示唆する可能性がある。SSR対SNPデータにより生成された結果の比較は,RAD-Seqにより生成された大きなマーカーセットが,SSRよりも高いレベルの遺伝的識別を提供するので,前進することを示唆した。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  キャラクタリゼーション ,  *疫病 ,  メキシコ合衆国 ,  個体群 ,  *遺伝子型 ,  二倍体 ,  生殖 ,  *ジャガイモ ,  一塩基多型 ,  デンマーク王国 ,  *Phytophthora ,  病原体
準シソーラス用語： 分離株 ,  *ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： クローン性 ,  Phytophthora感染症 ,  植物病原菌 ,  倍数性 ,  人口構造 ,  RADシークエンシング ,  SNPs

分類 (1件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y)

タイトルに関連する用語 (9件)： ジャガイモ ,  疫病 ,  病原菌 ,  Phytophthora ,  集団 ,  ゲノミクス ,  クローン性 ,  遺伝子型 ,  多様性