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J-GLOBAL ID：201902249462647141   整理番号：19A1883598

PE555複合体における励起子動力学に対する蛋白質配置効果【JST・京大機械翻訳】

Protein Arrangement Effects on the Exciton Dynamics in the PE555 Complex

著者 (3件)： Chandrasekaran Suryanarayanan (Department of Physics and Earth Sciences, Jacobs University Bremen, Germany) ,  Pothula Karunakar Reddy (Department of Physics and Earth Sciences, Jacobs University Bremen, Germany) ,  Kleinekathoefer Ulrich (Department of Physics and Earth Sciences, Jacobs University Bremen, Germany)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 15  ページ： 3228-3236  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フィコビリン蛋白質アンテナ複合体PE555の環境結合とその励起子エネルギー移動機構を詳細に研究した。古典的基底状態軌道に沿った垂直遷移エネルギーの計算に続いて,分子動力学シミュレーションを行った。この目的のために,PE555複合体に対するエネルギーレベルの分布は,それぞれの蛋白質構造の明確な違いにもかかわらず,PE545複合体の分布と類似していることが分かった。PE555錯体において,2つのαβ単量体は水充填チャンネルをもたらすPE545構造と比較して~73°回転した。さらに,これらの凝集体における色素として作用するビリン間の結合,および蛋白質は2つの構造において明確な差異を示す。しかしながら,個々の発色団の蛋白質環境への結合を分析することにより,2つの蛋白質複合体において類似のスペクトル密度が得られた。さらに,静電ポテンシャル(Treep)法からの遷移電荷を用いて電子結合を計算するために,含まれるビリンの部分遷移電荷を決定した。比較のために,点-双極子近似を用いて結合を抽出した。平均して,双極子近似によって予測された結合値は,アンサンブル平均波束動力学で試験されたように,強化された集団減衰速度をもたらすTreep法からのそれらよりわずかに大きい。さらに,PE555構造における励起子動力学は,単量体の異なる配置により誘起されたより小さい結合値により,PE545錯体におけるよりも著しく遅かった。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *励起子 ,  発色団 ,  電荷 ,  チャネル ,  計算機シミュレーション ,  色素 ,  *複合体 ,  錯体 ,  単量体 ,  アンテナ ,  エネルギー移動 ,  *タンパク質 ,  タンパク質複合体
準シソーラス用語： 双極子近似 ,  静電ポテンシャル ,  ビリン , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 光合成  (EB10020I) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子の電子構造  (BH05010Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 複合体 ,  励起子 ,  動力学 ,  蛋白質