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J-GLOBAL ID：201902251035108331   整理番号：19A1804562

水素-重水素交換捕獲イオン移動度分光法-質量分析と分子動力学を用いたチトクロームcの分子内相互作用の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of Intramolecular Interactions of Cytochrome c Using Hydrogen-Deuterium Exchange-Trapped Ion Mobility Spectrometry-Mass Spectrometry and Molecular Dynamics

著者 (9件)： Molano-Arevalo Juan Camilo (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Florida, United States) ,  Jeanne Dit Fouque Kevin (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Florida, United States) ,  Pham Khoa (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Florida, United States) ,  Miksovska Jaroslava (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Florida, United States) ,  Miksovska Jaroslava (Biomolecular Sciences Institute, Florida International University, Florida, United States) ,  Ridgeway Mark E. (Bruker Daltonics, Inc., Massachusetts, United States) ,  Park Melvin A. (Bruker Daltonics, Inc., Massachusetts, United States) ,  Fernandez-Lima Francisco (Department of Chemistry and Biochemistry, Florida International University, Florida, United States) ,  Fernandez-Lima Francisco (Biomolecular Sciences Institute, Florida International University, Florida, United States)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 89  号： 17  ページ： 8757-8765  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： チトクロームc(cytc)のような球状蛋白質は,水素結合相互作用ネットワークにより維持される組織化天然立体配座を示す。本研究では,イオン-中性衝突断面積(CCS)と電荷状態を,衝突誘起活性化(CIA),時間分解水素/重水素逆交換(HDX),及び捕獲イオン移動度分光質量分析(TIMS-MS)を用いて,イオン-中性衝突断面積(CCS)と電荷状態を相関させることによって行った。TIMS分析器の高いイオン移動度分解能は,新しいイオン移動度バンドの同定を可能にし,+6から+21の電荷状態にわたる合計63の移動度バンドと-5から-10の電荷状態にわたる20の移動度バンドをもたらした。移動度選択HDX速度は,同じ電荷状態に対して,より大きなCCSを有する配座異性体が正と負のイオンモードの両方でより速いHDX速度を示し,アクセス可能な表面積上の電荷サイトと隣接交換サイトが電荷状態に関係なく交換速度を定義することを示唆した。相補的分子動力学シミュレーションにより,候補構造の生成と天然(N)から溶融小球体(MG)への折畳み遷移の機構モデルを,速度論的中間体(U)経路へと可能にした。著者らの結果は,cytcの主要な構造的変性が,N-およびC-末端ヘリックスの切断およびその後の疎水性ヘム含有空洞の溶媒曝露と関連していることを示唆する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 速度論 ,  *質量分析 ,  計算機シミュレーション ,  *イオン ,  *キャラクタリゼーション ,  ミクロスフェア ,  *捕獲 ,  *スペクトロスコピー ,  立体配座 ,  疎水性 ,  電荷 ,  *チトクロームc ,  折畳み ,  *イオン移動度
準シソーラス用語： 荷電状態 ,  衝突断面積 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 質量分析  (CC03013N)

タイトルに関連する用語 (8件)： 水素-重水素交換 ,  捕獲 ,  イオン移動度分光法 ,  質量分析 ,  分子動力学 ,  チトクロームC ,  分子内相互作用 ,  特性化