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J-GLOBAL ID：201902251309367364   整理番号：19A1407885

プローブとしての共結晶化補因子テトラヒドロ葉酸を用いた分子動力学シミュレーションによるLSD1/CoREST複合体の活性中心の探索【JST・京大機械翻訳】

Exploring the Active Center of the LSD1/CoREST Complex by Molecular Dynamics Simulation Utilizing Its Co-crystallized Co-factor Tetrahydrofolate as a Probe

著者 (2件)： Zalloum Waleed A. (Department of Pharmacy, Faculty of Health Science, American University of Madaba, Jordan) ,  Zalloum Hiba M. (Hamdi Mango Research Center for Scientific Research, The University of Jordan, Jordan)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 12  ページ： 3022-3031  発行年： 2017年12月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 癌の後成的標的化は,遺伝的材料を破壊することなく遺伝子を操作する最近の努力である。リジン特異的デメチラーゼ1(LSD1)は,クロマチンH3尾部のリジンアミノ酸を脱メチル化する翻訳後修飾のためのクロマチンに関連する酵素の1つである。多くの研究により,LSD1の阻害は癌のエピジェネティクス治療に利用できる可能性があることが示された。LSD1はそのコレプレッサー蛋白質CoRESTと関連し,脱メチル化過程からCH_2を受け入れるための補因子としてテトラヒドロ葉酸を使用する。本研究では,共結晶化補因子テトラヒドロ葉酸を用いて,LSD1/CoREST複合体の活性中心における可能な結合領域を決定した。また,錯体の柔軟性を分子動力学シミュレーションとクラスタ化と主成分分析によるその後の解析によって研究した。本研究は他の研究を支持し,LSD1/CoREST複合体が2つの主要な立体配座構造に存在することを示した。さらに,本研究は,テトラヒドロ葉酸がその入口においてそのオープン立体配座においてLSD1/CoREST複合体に安定に結合することを示した。それは次に複合体のコアに結合し,閉じた立体配座を誘導する。さらに,これらの2つの結合領域へのテトラヒドロ葉酸の相互作用およびテトラヒドロ葉酸の対応する結合様式を,構造に基づく薬物設計において用いるために研究した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クロマチン ,  立体配座 ,  *複合体 ,  ターゲティング ,  結合部位 ,  柔軟性 ,  クラスタ化 ,  遺伝子 ,  *補因子 ,  アミノ酸 ,  脱メチル ,  *計算機シミュレーション ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： *リジンデメチラーゼ1 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *共結晶化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (1件)： リジン

タイトルに関連する用語 (10件)： プローブ ,  共結晶化 ,  補因子 ,  テトラヒドロ葉酸 ,  分子動力学シミュレーション ,  LSD1 ,  CoREST ,  複合体 ,  活性中心 ,  探索