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J-GLOBAL ID：201902251497135036   整理番号：19A0176778

AptA-Seqによる多重アプタマー発見とヒト-ゲノムSELEX由来ATPアプタマーへの応用【JST・京大機械翻訳】

Multiplex Aptamer Discovery through Apta-Seq and Its Application to ATP Aptamers Derived from Human-Genomic SELEX

著者 (9件)： Abdelsayed Michael M. (Department of Molecular Biology and Biochemistry, University of California-Irvine, California, United States) ,  Ho Bao T. (Department of Pharmaceutical Sciences, University of California-Irvine, California, United States) ,  Vu Michael M. K. (Department of Chemistry, University of California-Irvine, California, United States) ,  Polanco Julio (Department of Molecular Biology and Biochemistry, University of California-Irvine, California, United States) ,  Spitale Robert C. (Department of Pharmaceutical Sciences, University of California-Irvine, California, United States) ,  Spitale Robert C. (Department of Chemistry, University of California-Irvine, California, United States) ,  Luptak Andrej (Department of Molecular Biology and Biochemistry, University of California-Irvine, California, United States) ,  Luptak Andrej (Department of Pharmaceutical Sciences, University of California-Irvine, California, United States) ,  Luptak Andrej (Department of Chemistry, University of California-Irvine, California, United States)
資料名： ACS Chemical Biology  (ACS Chemical Biology)
巻： 12  号： 8  ページ： 2149-2156  発行年： 2017年 
JST資料番号： W5037A  ISSN： 1554-8937  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 実験室で進化したRNAは,広範囲の標的に結合し,診断および治療用アプタマーとして含まれる高度に多様な機能を果たしている。多くのアプタマーは,濃縮と増幅の連続的なラウンドを通して高度に多様なプールから標的結合RNAを選択することに基づく分子進化技術であるin vitro選択(SELEX)を用いて同定されている。in vitroでの選択は,典型的には,高度に変動する豊富さと標的結合親和性の複数の異なるモチーフを生じる。新しいアプタマーの発見は,個々の配列の試験が面倒な過程である傾向があるので,選択されたモチーフの特性化の困難さによってしばしば制限される。in vitro選択プール内の新しいアプタマーの発見を容易にするため,選択RNAプールの溶媒アクセス可能領域の定量的,リガンド依存性2′アシル化に基づく多重分析,逆転写(SHAPE)と深い配列決定に基づくApta-Seqを開発した。この方法は,単一配列決定実験において,選択したプール中に存在するアプタマーに対する同一性,構造的特徴及び標的解離定数を明らかにした。ATP結合RNAに富むヒトゲノムプールへのApta-Seqの応用は,以前に同定されたヒトアプタマーと共に,リガンド結合RNAが哺乳類において一般的であることを示唆する3つの新しいアプタマーをもたらした。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ヒト ,  分子進化 ,  キャラクタリゼーション ,  哺乳類 ,  治療法 ,  *多重化 ,  *ゲノム ,  アシル化 ,  解離定数 ,  逆転写 ,  in vitro実験 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 結合親和性 ,  *SELEX法 ,  *アプタマー , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 多重 ,  アプタマー ,  発見 ,  ヒト ,  ゲノム ,  SELEX ,  ATP ,  応用