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J-GLOBAL ID：201902252700822218   整理番号：19A1055646

RNA-seqを用いたヨーロッパヘーゼルナッツ(Corylus avellana L.)における芽バースト過程の遺伝子発現解析【JST・京大機械翻訳】

Gene expression analysis of bud burst process in European hazelnut (Corylus avellana L.) using RNA-Seq

著者 (3件)： Kavas Musa (Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ondokuz Mayis University, Samsun, Turkey) ,  Kurt Kizildogan Aslihan (Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ondokuz Mayis University, Samsun, Turkey) ,  Balik Hueseyin Irfan (Giresun Hazelnut Research Station, Ministry of Food, Agriculture and Livestock, Giresun, Turkey)
資料名： Physiology and Molecular Biology of Plants  (Physiology and Molecular Biology of Plants)
巻： 25  号： 1  ページ： 13-29  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4848A  ISSN： 0971-5894  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 温度に依存する芽のバースト過程の制御は,好ましくない生態学的条件において生存する木質多年生植物における重要な因子である。重要な経済的および農業的価値があるが,Corylus avellanaにおける芽バースト過程の分子機構に関する情報はほとんどない。ここでは,初めて,エコ休眠葉芽組織を用いたde novoトランスクリプトームに基づく実験を行った。4つのトランスクリプトームライブラリーを葉芽組織から構築し,Illinaプラットフォームを介して配列決定した。トランスクリプトーム解析により,平均長1189ntおよび1916ntのN50を有する86,394の単一遺伝子を明らかにした。これらの単一遺伝子の間で,それらの63,854(73.78%)は少なくとも1つのデータベースによって注釈された。de novo集合転写物はフェニルプロパノイド代謝,植物ホルモン生合成およびシグナル伝達経路に富んでいた。植物ホルモン関連遺伝子の分析は,ジベレリン酸,オーキシン,およびブラシノステロイドに応答して,芽バーストの間に重要な変化を明らかにした。約2163の推定転写因子が予測され,その中で最大数のユニークな転写物がMYB転写因子ファミリーに属していた。これらの結果は多年生植物における芽バースト遺伝子の調節のより良い理解に寄与する。Copyright 2018 Prof. H.S. Srivastava Foundation for Science and Society Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  多年生草 ,  *遺伝子 ,  *RNA【核酸】 ,  転写因子 ,  生合成 ,  農業 ,  オーキシン ,  トランスクリプトーム ,  *バースト ,  休眠 ,  植物ホルモン
準シソーラス用語： 分子機構 ,  *ヘーゼルナッツ ,  *RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 芽のバースト ,  休眠 ,  ヘーゼルナッツ ,  フェニルプロパノイド代謝 ,  植物ホルモン生合成 ,  RNA-seq

分類 (4件)： 豆類  (FC03035U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  作物の品種改良  (FC02030G)

タイトルに関連する用語 (8件)： RNA-seq ,  ヨーロッパ ,  ヘーゼルナッツ ,  Corylus ,  芽 ,  バースト ,  過程 ,  遺伝子発現解析