文献

J-GLOBAL ID：201902253088797059   整理番号：19A0494499

次世代シークエンシングはB染色体の配列構成と起源の理解を支援する【JST・京大機械翻訳】

How Next-Generation Sequencing Has Aided Our Understanding of the Sequence Composition and Origin of B Chromosomes

著者 (4件)： Ruban Alevtina (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research Gatersleben, 06466 Seeland, Germany) ,  Schmutzer Thomas (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research Gatersleben, 06466 Seeland, Germany) ,  Scholz Uwe (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research Gatersleben, 06466 Seeland, Germany) ,  Houben Andreas (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research Gatersleben, 06466 Seeland, Germany)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 11  ページ： 294  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの真核生物核型において,付属,過剰,最も単純なB染色体が見出されている。これらの小染色体は通常の分離パターンに従わないが,むしろ予想される周波数よりも高い透過率を示す。次世代配列決定(NGS)により示されているように,それらの構造は標準(A)染色体の断片から成るが,いくつかの植物種においても,それらの配列はオルガネラゲノムからの寄与も含んでいる。種々の動物および植物種のトランスクリプトーム解析は,一般的な信念とは反対に,B染色体DNAのいくつかが蛋白質コード化であることを明らかにした。本レビューでは,次世代シークエンシング技術と最先端のバイオインフォマティクスの応用により可能になったB染色体生物学の理解における進歩を要約した。特に,B染色体配列の同定に向けて得られる代替経路として,直接配列決定法と比較ゲノミクスに基づく戦略との間のコントラストを引き出した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 動物 ,  ゲノム ,  DNA【核酸】 ,  タンパク質 ,  オルガネラ ,  真核生物 ,  *染色体 ,  コントラスト
準シソーラス用語： 比較ゲノミクス ,  ダイレクトシークエンス法 ,  バイオインフォマティクス ,  トランスクリプトーム解析 ,  植物種 ,  *B染色体 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： B染色体 ,  過剰染色体 ,  進化 ,  次世代シークエンシング

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (77件)：

• Jones, R.N. B-chromosome drive. Am. Nat. 1991, 137, 430-442.
• Houben, A. B chromosomes-A matter of chromosome drive. Front. Plant Sci. 2017, 8.
• Martis, M.M.; Klemme, S.; Banaei-Moghaddam, A.M.; Blattner, F.R.; Macas, J.; Schmutzer, T.; Scholz, U.; Gundlach, H.; Wicker, T.; Simkova, H.; et al. Selfish supernumerary chromosome reveals its origin as a mosaic of host genome and organellar sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012, 109, 13343-13346.
• Klemme, S.; Banaei-Moghaddam, A.M.; Macas, J.; Wicker, T.; Novák, P.; Houben, A. High-copy sequences reveal distinct evolution of the rye B-chromosome. New Phytol. 2013, 199, 550-558.
• Ruban, A.; Fuchs, J.; Marques, A.; Schubert, V.; Soloviev, A.; Raskina, O.; Badaeva, E.; Houben, A. B chromosomes of Aegilops speltoides are enriched in organelle genome-derived sequences. PLoS ONE 2014, 9, e90214.

タイトルに関連する用語 (5件)： 次世代シークエンシング ,  B染色体 ,  起源 ,  理解 ,  支援