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J-GLOBAL ID：201902253786192701   整理番号：19A2365780

肝臓有機アニオン輸送ポリペプチドのリガンドプロファイルを探索するための統合データマイニング,足場分析,および逐次二成分分類モデル【JST・京大機械翻訳】

Integrative Data Mining, Scaffold Analysis, and Sequential Binary Classification Models for Exploring Ligand Profiles of Hepatic Organic Anion Transporting Polypeptides

著者 (3件)： Tuerkova Alzbeta (Department of Pharmaceutical Chemistry, Divison of Drug Design and Medicinal Chemistry, University of Vienna, Austria) ,  Jain Sankalp (Department of Pharmaceutical Chemistry, Divison of Drug Design and Medicinal Chemistry, University of Vienna, Austria) ,  Zdrazil Barbara (Department of Pharmaceutical Chemistry, Divison of Drug Design and Medicinal Chemistry, University of Vienna, Austria)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 59  号： 5  ページ： 1811-1825  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肝細胞有機アニオン輸送ポリペプチド(OATP1B1,OATP1B3,OATP2B1)は,適切な肝機能と薬物除去過程の調節に重要である。肝臓毒性と癌の異なる条件におけるそれらの役割を理解することは,肝臓OATPリガンド相互作用と選択性の徹底的な研究を必要とする。しかしながら,そのような研究は,結晶構造の欠如,これらの輸送体の有望な性質,および信頼できる生物活性データの限られた利用可能性によって妨げられており,それはオープンドメインにおける異なるデータ源上に広がっている。この目的のために,半自動KNIMEワークフローにおいて,5つのオープンデータソース(ChEMBL,UCSF-FDA輸送データベース,DrugBank,Metrabase,およびIUPHAR)からの肝臓OATPsに対するリガンド生物活性データを統合した。濃縮足場に関して高度にカールしたデータセットを分析し,それらの活性プロファイルおよび肝臓OATPsに対する選択的,二重または汎阻害活性に対する指標を提供する興味ある足場シリーズを抽出することができた。さらに,逐次二成分モデリングアプローチにより,個々の輸送体に対する阻害活性に対する一般的で明確なリガンドの特徴が明らかになった。オープンソースからデータを統合するために設計されたワークフロー,データカーレーション,およびその後のサブ構造解析は,自由に利用可能で,完全に適応可能である。肝臓OATPsの阻害剤と基質に対する新しいデータセットと特徴及びサブ構造解析により提供される洞察は,肝臓OATPリガンド相互作用及び選択性に関する将来の構造に基づく研究を導くであろう。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物活性 ,  相互作用 ,  基質 ,  構造解析 ,  結晶構造 ,  ワークフロー ,  肝細胞 ,  *データマイニング ,  データベース
準シソーラス用語： 阻害剤 ,  オープンソース ,  阻害活性 ,  ドメイン構造 ,  輸送体 ,  *OATP , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 薬物の構造活性相関  (GV01050B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (10件)： 肝臓 ,  有機アニオン輸送ポリペプチド ,  探索 ,  統合 ,  データマイニング ,  足場 ,  分析 ,  逐次 ,  二成分 ,  分類モデル