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J-GLOBAL ID：201902253843172918   整理番号：19A0936597

遺伝子標的miRNAsのスクリーニングと同定【JST・京大機械翻訳】

Screening and Identification of the Candidate Gene Target miRNAs for Cashmere Fineness

著者 (13件)： Hui Taiyu (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Zheng Yuanyuan (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Yue Chang (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Sun Jiaming (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Guo Dan (遼寧省畜牧科学研究院,遼寧遼陽,111000) ,  Guo Suling (内蒙古烏蘭察布市化徳県長順鎮繁栄社区,内蒙古化徳,013350) ,  Wang Yiru (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Liu Yuhao (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Wang Zicheng (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Wang Yingxuan (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Huang Lifei (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Bai Wenlin (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161) ,  Wang Zeying (沈陽農業大学畜牧獣医学院,沈陽,110161)
資料名： Shenyang Nongye Daxue Xuebao  (Shenyang Nongye Daxue Xuebao)
巻： 50  号： 1  ページ： 19-27  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2349A  ISSN： 1000-1700  CODEN： SNDBE7  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 遼寧カシミアヤギの粗型と細型個体のカシミアの細度に関連する候補遺伝子ALX4、NT-3、POLD2とAKT1の発現調節潜在標的miRNAsとその発現差異を選別し、検証するため、遼寧カシミアヤギの細型と粗型皮膚組織DNAとRNAを抽出した。遼寧カシミアヤギの粗型と細型肩甲部皮膚組織を採集し、NCBI上の配列クローンによりALX4、NT-3、POLD2とAKT1遺伝子の3’UTRを獲得し、Primer5.0を用いて機能プライマーを設計し、合成し、通常のPCRによりALX4、A1遺伝子の増幅を行った。NT-3,POLD2及びAKT1遺伝子の3’UTR配列は,miRBaseデータベースにおいて,ヒツジカシミアの候補標的遺伝子3’UTR標的miRNAsをスクリーニングした。その後、遼寧カシミアヤギ(LCG)と内モンゴルカシミアヤギ(MCG)品種間の皮膚miRNAsハイスループットシークエンシングの結果と共焦し、カシミア細度に関連する候補遺伝子発現制御潜在標的miRNAsをスクリーニングし、NCBIでmiRNAsの前駆体配列を検索した。RNAfoldを用いて、二次構造図とポテンシャルエネルギー図を獲得し、qPCRにより、細型遼寧カシミアヤギ(FinetypeLCG)と粗型遼寧カシミアヤギ(CoarsetypeLCG)皮膚組織中のカシミア細度候補遺伝子ALX4、NT-3、CK、C、B、C、POLD2とAKT1標的miRNAsの発現量を測定した。結果は以下を示した。miRBaseデータベースにより,ALX4,NT-3,POLD2,およびAKT1は,それぞれ104,27,19,および32の標的miRNAsを得て,カシミアヤギ品種間の皮膚miRNAsのハイスループットシークエンシングの結果と焦点を合わせた。ALX4遺伝子は3つの標的,miR-m13,miR-433-5pおよびmiR-671にフォーカスし,その発現は56,2および27であった。NT-3遺伝子は1つの標的miR-1296にフォーカスし,発現量は41であった。POLD2遺伝子は1つの標的miR-130bにフォーカスし,発現量は177であった。AKT1遺伝子は2つの標的miR-345-3pとmiR-2331-3pにフォーカスし,その発現量は52と5であった。そのうち、前駆体配列の二次構造はmiR-2331-3pの構造が最も不安定で、miR-1296の最小自由エネルギーの絶対値が最大で、構造が最も安定していることを示している。【結果】miR-m13,miR-433-5p,miR-671,miR-1296,miR-345-3pおよびmiR-2331-3pの発現レベルは,Liaoningカシミアヤギの皮膚における発現量よりも有意に高かった。おそらく、羊の細度候補遺伝子に対して重要な正の調節作用を発揮するが、miR-130bはLCGの粗型の発現量がLCGの細型の発現量より高く、おそらくmiR-130bは羊の細度に関連する候補遺伝子に対して負の制御作用を発揮する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  二次構造 ,  *RNA【核酸】 ,  データベース ,  品種 ,  *遺伝子ターゲティング ,  定量的PCR法 ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： ニューロトロフィン3 ,  配列解析 ,  *マイクロRNA ,  ハイスループット ,  3′非翻訳領域 ,  候補遺伝子 ,  カシミア , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子標的 ,  スクリーニング ,  同定