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J-GLOBAL ID：201902255035819355   整理番号：19A1806414

制限断片長多型に基づく方法によるin vivo転写後転写RNA修飾のサブセットの検出【JST・京大機械翻訳】

Detection of a Subset of Posttranscriptional Transfer RNA Modifications in Vivo with a Restriction Fragment Length Polymorphism-Based Method

著者 (14件)： Wulff Thomas F. (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Argueello Rafael J. (Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Aix-Marseille Universite U2M, Inserm, U1104, CNRS UMR7280, France) ,  Molina Jordan Marc (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Roura Frigole Helena (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Hauquier Glenn (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Filonava Liudmila (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Camacho Noelia (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Gatti Evelina (Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Aix-Marseille Universite U2M, Inserm, U1104, CNRS UMR7280, France) ,  Gatti Evelina (Institute for Research in Biomedicine (iBiMED) and Aveiro Health Sciences Program, University of Aveiro, Portugal) ,  Pierre Philippe (Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Aix-Marseille Universite U2M, Inserm, U1104, CNRS UMR7280, France) ,  Pierre Philippe (Institute for Research in Biomedicine (iBiMED) and Aveiro Health Sciences Program, University of Aveiro, Portugal) ,  Ribas de Pouplana Lluis (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain) ,  Ribas de Pouplana Lluis (Catalan Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), Catalonia, Spain) ,  Torres Adrian G. (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), The Barcelona Institute of Science and Technology, Catalonia, Spain)
資料名： Biochemistry  (Biochemistry)
巻： 56  号： 31  ページ： 4029-4038  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0270B  ISSN： 0006-2960  CODEN： BICHAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写RNA(tRNA)は最も高度に修飾されたRNA種の中にある。転写後tRNA修飾(pTRMs)はtRNA構造と機能の調節において基本的役割を果たし,ヒトの生理学と疾患にますます関連している。pTRMsの検出は,しばしば困難で,高価で,労力がかかる。制限断片長多型(RFLP)分析は制限酵素処理後のDNA切断パターンを研究し,mRNA上の修飾塩基の定性的検出に用いられている。tRNAが逆転写されると,いくつかのpTRMsが特異的で再現性のある塩基「突然変異」を誘導することが知られている。例えば,アデノシンの脱アミノ化から誘導されるイノシンは,イノシン含有tRNAが逆転写され,ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を介して増幅され,逆転写反応の結果として生成された逆転写PCRアンプリコンにおけるptRM依存性塩基変化が,エンドヌクレアーゼ制限部位を生成または消失させる可能性がある。pTRMsの検出及び/又は定量に対するRFLPの適合性はこれまで研究されていない。ここでは,異なるpTRMsがRFLPにより異なるtRNA型の特異的部位で検出できることを示した。研究した例に対して,このアプローチは,遺伝子発現におけるtRNA修飾の調節的役割の研究において有用な特徴である試料の修飾状態を確実に推定できることを示した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 逆転写 ,  tRNA ,  適応性 ,  遺伝子発現 ,  再現性 ,  突然変異 ,  PCR法 ,  mRNA ,  *RNA【核酸】 ,  ヒト ,  *部分集合 ,  プリンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド ,  診断用薬
準シソーラス用語： アンプリコン ,  *RNA修飾 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (2件)： イノシン ,  アデノシン

タイトルに関連する用語 (4件)： 制限断片長多型 ,  転写 ,  RNA修飾 ,  サブ