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J-GLOBAL ID：201902255838422147   整理番号：19A2220557

中国からの臨床多剤耐性結核菌分離株における13抗結核薬の耐性を診断するための全ゲノム配列法の評価と耐性遺伝子の特性化【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of Whole-Genome Sequence Method to Diagnose Resistance of 13 Anti-tuberculosis Drugs and Characterize Resistance Genes in Clinical Multi-Drug Resistance Mycobacterium tuberculosis Isolates From China

著者 (6件)： Chen Xinchang (Department of Infectious Diseases, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  He Guiqing (Sixth People’s Hospital of Wenzhou City, Shenzhen, China) ,  Wang Shiyong (Department of Infectious Diseases, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Lin Siran (Department of Infectious Diseases, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Chen Jiazhen (Department of Infectious Diseases, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhang Wenhong (Department of Infectious Diseases, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 1741  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:全ゲノム配列決定(WGS)は,先進国における薬剤耐性のタイムリーで包括的な診断のための実行可能で経済的に実行可能なツールである。多剤耐性結核(MDR-TB)の発生率の増加に伴い,第二線抗TB薬は重要性を増している。しかしながら,WGSに基づく二次抗TB薬に対する遺伝的耐性は完全には研究されていない。【方法】中国,浙江省の病院から100のMDR-TBと10の非MDR-TB分離株をランダムに選択した。13の抗TB薬に対する薬剤感受性試験を実施し,34の薬剤耐性関連遺伝子をすべての分離株においてWGSを用いて分析した。各薬剤について,WGSの精度,感度,特異性および陽性および陰性予測値を従来の薬剤感受性試験のそれらと比較した。結果:WGSに対する全体の感度と特異性は,それぞれ,イソニアジド(INH)に対し99.0と100.0%,ethfloxacinに対し94.8と65.3%,proacinに対し90.9と95.1%,para thiに対し90.9と95.1%,cloazに対し85.7と85.1%,クロファジミン(CLO)に対し66.7と95.9%であった。結論:WGSは,INH,RIF,PZA,LFX,SM,二次注射薬(スライド)およびPTOに対する耐性を予測する有望なアプローチであり,満足な精度,感度および特異性は85.0%以上であった。EMBに対する耐性の診断におけるWGSの特異性とMFXに対する高レベル耐性(2.0mg/L)は改善される必要がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *遺伝 ,  スライド ,  *キャラクタリゼーション ,  先進国 ,  *抗結核薬 ,  薬物耐性
準シソーラス用語： 予測値 ,  特異性 ,  薬剤感受性試験 ,  浙江省 ,  *多剤耐性結核 ,  *ゲノム配列 ,  *分離株 ,  *多剤耐性結核菌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 薬剤耐性 ,  薬剤感受性試験 ,  全ゲノム配列決定 ,  多剤耐性結核 ,  突然変異

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (52件)：

• Alland D., Steyn A. J., Weisbrod T., Aldrich K., Jacobs W. R. (2000). Characterization of the Mycobacterium tuberculosis iniBAC promoter, a promoter that responds to cell wall biosynthesis inhibition. J. Bacteriol. 182, 1802-1811. doi: 10.1128/JB.182.7.1802-1811.2000
• Allix-Béguec C., Arandjelovic I., Bi L., Beckert P., Bonnet M., Bradley P., et al. (2018). Prediction of susceptibility to first-line tuberculosis drugs by DNA sequencing. N. Engl. J. Med. 379, 1403-1415. doi: 10.1056/NEJMoa1800474
• Almeida D., Ioerger T., Tyagi S., Li S. Y., Mdluli K., Andries K., et al. (2016). Mutations in pepQ confer Low-Level resistance to bedaquiline and clofazimine in Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob. Agents Chemother. 60, 4590-4599. doi: 10.1128/AAC.00753-16
• Brossier F., Veziris N., Truffot-Pernot C., Jarlier V., Sougakoff W. (2011). Molecular investigation of resistance to the antituberculous drug ethionamide in multidrug-resistant clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob. Agents Chemother. 55, 355-360. doi: 10.1128/AAC.01030-10
• Chakraborty S., Gruber T., Barry C. E., Boshoff H. I., Rhee K. Y. (2013). Para-aminosalicylic acid acts as an alternative substrate of folate metabolism in Mycobacterium tuberculosis. Science 339, 88-91. doi: 10.1126/science.1228980

タイトルに関連する用語 (11件)： 中国 ,  臨床 ,  多剤耐性結核菌 ,  分離株 ,  抗結核薬 ,  耐性 ,  診断 ,  ゲノム配列 ,  評価 ,  耐性遺伝子 ,  特性化