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J-GLOBAL ID：201902256278468855   整理番号：19A2464459

Arabidopsis thaliana由来の強力なNF-κB p65応答性シス調節配列はWRKY40と相互作用する【JST・京大機械翻訳】

A strong NF-κB p65 responsive cis-regulatory sequence from Arabidopsis thaliana interacts with WRKY40

著者 (6件)： Kanofsky Konstantin (Institut fuer Genetik, Technische Universitaet Braunschweig, Braunschweig, Germany) ,  Riggers Jasmin (Institut fuer Genetik, Technische Universitaet Braunschweig, Braunschweig, Germany) ,  Staar Marcel (Institut fuer Genetik, Technische Universitaet Braunschweig, Braunschweig, Germany) ,  Strauch Claudia Janina (Institut fuer Genetik, Technische Universitaet Braunschweig, Braunschweig, Germany) ,  Arndt Laureen Christin (Institut fuer Genetik, Technische Universitaet Braunschweig, Braunschweig, Germany) ,  Hehl Reinhard (Institut fuer Genetik, Technische Universitaet Braunschweig, Braunschweig, Germany)
資料名： Plant Cell Reports  (Plant Cell Reports)
巻： 38  号： 9  ページ： 1139-1150  発行年： 2019年 
JST資料番号： E0975A  ISSN： 0721-7714  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 先天性免疫において役割を果たす哺乳類と植物からの転写因子は,Arabidopsis thalianaからの同じ微生物関連分子パターン(MAMP)応答配列と相互作用する。WTボックスのコアモチーフGACTTTを含むMAMP応答配列とマウスNF-κB p65の相互作用を調べた。これは,植物細胞におけるNF-κB p65依存性レポーター遺伝子発現を非常に強く活性化するために,未知の機能を持つ遺伝子,A.thaliana遺伝子At1g76960のプロモーターから誘導された1つの配列を明らかにした。生物情報学的解析は,この配列における3つの推定NF-κB p65結合部位を予測し,3つの部位すべてがレポーター遺伝子活性化と結合に必要である。配列は以前に分離された最も弱いMAMP応答配列の1つであるが,GCCボックスの導入は上流WTボックス配列と組み合わせてMAMP応答性を増加させる。非変異cis配列の生物情報学的分析はNF-κB p65結合のみを予測するが,A.thaliana WRKY40は酵母1ハイブリッドスクリーニングで選択された。転写レプレッサーであるWRKY40は,直接結合のためにTTTTCTA配列を必要とする。この配列は,以前にタバコNtWRKY12と相互作用することが示されたWKボックスTTTTCCACと類似していた。まとめると,本研究はNF-κBとWRKY因子間の結合部位認識の類似性を支持する。Copyright 2019 Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酵母 ,  *相互作用 ,  レプレッサー ,  *Arabidopsis thaliana ,  *Arabidopsis ,  *NFκB ,  タバコ ,  プロモーター領域 ,  レポーター遺伝子 ,  結合部位 ,  遺伝子 ,  変異
準シソーラス用語： *WRKY蛋白質 ,  バイオインフォマティクス ,  *p65 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Arabidopsis thaliana ,  MAMP ,  NF-κB ,  植物合成プロモーター ,  一過性遺伝子発現解析 ,  WRKY ,  WTボックス

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： Arabidopsis ,  NF-κB ,  p65 ,  応答性 ,  調節配列 ,  相互作用