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J-GLOBAL ID：201902256858058968   整理番号：19A0660135

構造サブユニットからの膜蛋白質の反磁性磁化率と反磁性異方性の計算【JST・京大機械翻訳】

Computing the Diamagnetic Susceptibility and Diamagnetic Anisotropy of Membrane Proteins from Structural Subunits

著者 (5件)： Babaei Mahnoush (Department of Civil and Environmental Engineering, Carnegie Mellon University, Pennsylvania, United States) ,  Jones Isaac C. (Department of Civil and Environmental Engineering, Carnegie Mellon University, Pennsylvania, United States) ,  Dayal Kaushik (Department of Civil and Environmental Engineering, Carnegie Mellon University, Pennsylvania, United States) ,  Mauter Meagan S. (Department of Civil and Environmental Engineering, Carnegie Mellon University, Pennsylvania, United States) ,  Mauter Meagan S. (Department of Engineering and Public Policy, Carnegie Mellon University, Pennsylvania, United States)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 6  ページ： 2945-2953  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 磁場の存在下での大きな複雑な分子の挙動は実験的に挑戦的であり,予測するためには計算的に集中的である。本研究では,膜蛋白質の主磁化率と反磁性異方性を効率的に計算するための新しい混合法アプローチを提案した。膜貫通蛋白質の階層的一次(アミノ酸),二次(αヘリックス及びβシート)及び三次(αヘリックス及びβバレル)構造は,サイズ及び分解能を変化させた離散サブユニットを用いた複雑な分子の解析を可能にした。提案した方法は,全ての蛋白質サブユニットに対する磁化率テンソルを単位座標系に変換し,膜蛋白質に対する磁化率テンソルを構築することを意味する。このアプローチを用いて,既知構造の全ての膜貫通蛋白質に対する反磁性異方性を計算し,反磁性異方性の結果としての予測に及ぼす異なるサブユニット分解能の影響を調べた。芳香族側鎖を有するアミノ酸残基は,より高い反磁性異方性を示すことを実証した。平均して,高い割合の芳香族アミノ酸サブユニット,βバレル三次構造,および小体積は高い体積反磁性異方性と相関している。最後に,残基の空間位置を計算することが複雑な蛋白質分子の磁気的性質を正確に計算するために重要であることを示した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *サブユニット ,  *磁化率 ,  三次構造 ,  *異方性 ,  側鎖 ,  テンソル ,  膜貫通タンパク質 ,  磁場 ,  β構造 ,  *タンパク質 ,  アミノ酸残基 ,  *反磁性 ,  分解能
準シソーラス用語： 残基 ,  αヘリックス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

タイトルに関連する用語 (6件)： サブユニット ,  膜蛋白質 ,  反磁性 ,  磁化率 ,  異方性 ,  計算