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J-GLOBAL ID：201902257759621946   整理番号：19A2299957

単一分子Foerster共鳴エネルギー移動へのBayes非パラメトリック法【JST・京大機械翻訳】

A Bayesian Nonparametric Approach to Single Molecule Foerster Resonance Energy Transfer

著者 (8件)： Sgouralis Ioannis (Center for Biological Physics, Department of Physics, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Madaan Shreya (School of Computing, Informatics, and Decision Systems Engineering, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Djutanta Franky (Biodesign Center for Molecular Design and Biomimetics, Biodesign Institute, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Kha Rachael (School for Engineering of Matter, Transport and Energy, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Hariadi Rizal F. (Center for Biological Physics, Department of Physics, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Hariadi Rizal F. (Biodesign Center for Molecular Design and Biomimetics, Biodesign Institute, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Presse Steve (Center for Biological Physics, Department of Physics, Arizona State University, Arizona, United States) ,  Presse Steve (School of Molecular Sciences, Arizona State University, Arizona, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 123  号： 3  ページ： 675-688  発行年： 2019年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単一分子FRET(smFRET)データを解析するためのBayes非パラメトリックフレームワークを開発した。このフレームワークは,無限隠れMarkovモデルに関する変動であり,従来の隠れMarkov解析を超えている。これは,3つの重要な方法において,すでに光子ショット雑音を扱う。(1)smFRET時間トレース(非パラメトリックアプローチの特徴)に存在する分子状態の数を学習する。(2)ドナーとアクセプタ蛍光体の光物理的特徴(結合速度論,スペクトルクロストーク,検出器量子効率),及び(3)バックグラウンド光子を扱う。点2は,雑音のある単一分子時間トレースを過剰解釈するための非パラメトリック手法の傾向を低減し,光物理的アーチファクトに対してロバストな状態と遷移速度論を推定するために不可欠である。結果として,提案した枠組みにより,供給トレースが過剰に雑音があり,光アーチファクトを受け,短時間の場合でも,単一分子特性の正確な推定を得た。合成データセットを用いて著者らの方法を検証し,従来の蛍光色素で標識されたHollidayジャンクションに関する単一分子実験からの実データセットへの適用性を実証した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ドナー ,  隠れMarkovモデル ,  速度論 ,  アクセプタ ,  *ノンパラメトリック法 ,  クロストーク ,  雑音 ,  検出器 ,  アーチファクト ,  ロバスト性 ,  ショット雑音 ,  光子 ,  スペクトル
準シソーラス用語： 蛍光色素 ,  *単一分子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  ルミネセンス一般  (BM08091B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 単一分子 ,  Foerster共鳴エネルギー移動 ,  非パラメトリック法