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J-GLOBAL ID：201902258141851160   整理番号：19A0965933

84の日本ウナギの全ゲノム配列決定はPanmixiaに対する証拠を明らかにし同所性種分化のための支持を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Whole-Genome Sequencing of 84 Japanese Eels Reveals Evidence against Panmixia and Support for Sympatric Speciation

著者 (23件)： Igarashi Yoji (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Zhang Hong (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Tan Engkong (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Sekino Masashi (National Research Institute of Fisheries Science, Japan Fisheries Research and Education Agency, Yokohama, Kanagawa 236-8648, Japan) ,  Yoshitake Kazutoshi (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Kinoshita Shigeharu (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Mitsuyama Susumu (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Yoshinaga Tatsuki (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan) ,  Chow Seinen (National Research Institute of Fisheries Science, Japan Fisheries Research and Education Agency, Yokohama, Kanagawa 236-8648, Japan) ,  Kurogi Hiroaki (Yokosuka Laboratory, National Research Institute of Aquaculture, Japan Fisheries Research and Education Agency, Yokosuka, Kanagawa 238-0316, Japan) ,  Shinoda Akira (Department of Biology, Tokyo Medical University, Tokyo 160-8402, Japan) ,  Han Yu-San (Institute of Fishery Science, College of Life Science, National Taiwan University, Taipei 10617, Taiwan) ,  Wakiya Ryoshiro (Bioresource Sciences, Faculty of Agriculture, Kyushu University, Fukuoka 812-0053, Japan) ,  Mochioka Noritaka (Bioresource Sciences, Faculty of Agriculture, Kyushu University, Fukuoka 812-0053, Japan) ,  Yamamoto Toshihiro (Yokosuka Laboratory, National Research Institute of Aquaculture, Japan Fisheries Research and Education Agency, Yokosuka, Kanagawa 238-0316, Japan) ,  Kuwada Hiroshi (Minami-Izu Laboratory, National Research Institute of Aquaculture, Japan Fisheries Research and Education Agency, Kamo, Shizuoka 415-0156, Japan) ,  Kaji Yoshitsugu (Wakayama Prefectural Museum of Natural History, Kainan, Wakayama 642-0001, Japan) ,  Suzuki Yutaka (Department of Medical Genome Science, Graduate School of Frontier Sciences, University of Tokyo, Kashiwa, Chiba 277-8561, Japan) ,  Gojobori Takashi (Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan, National Institute of Genetics, Mishima, Shizuoka 411-8540, Japan) ,  Kobayashi Takanori (National Research Institute of Fisheries Science, Japan Fisheries Research and Education Agency, Yokohama, Kanagawa 236-8648, Japan) ,  Saitoh Kenji (National Research Institute of Fisheries Science, Japan Fisheries Research and Education Agency, Yokohama, Kanagawa 236-8648, Japan) ,  Watabe Shugo (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan) ,  Asakawa Shuichi (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 9  号： 10  ページ： 474  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ニホンウナギ(Anguilla japonica),ヨーロッパウナギ(Anguilla anguilla)およびアメリカウナギ(Anguilla rostrata)は,いくつかの一般的なライフサイクルの特徴を共有している移動性で,catad性で,温帯域の魚である。これらのウナギ種における汎混合の個体群遺伝学は,すでに調査されている。著者らの広範な個体群遺伝学的解析は,84ウナギからの全ゲノム配列(WGS)データの1400Gbに基づいていた。それは,Kuma川からのニホンウナギ群が同じ種の他の個体群と異なることを示した。可能性のある適応/選択一塩基多型(SNP)データを除去し,非常に小さい差異(固定指数[Fst]=0.01)でさえ,著者らは結果を一貫して得た。これはパンミクサが日本ウナギでは起こらないことを示す。日本ウナギのライフサイクルは確立され,Kuma川はその生息地の中心にある。それにもかかわらず,単純な生殖隔離は,この種における非汎混合の可能性のある原因ではない。著者らは,産卵面積細分化,フィロパターン,および生息場所嗜好性/回避の組合せが,ニホンウナギ個体群における非汎混合を説明することを提案する。この仮説を,サブセットマッピング(RISM)モデルのような生殖隔離と名付けた。この発見は,これらのウナギにおける同所性種分化の初期段階を示す可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 部分集合 ,  集団遺伝 ,  河川 ,  生息場所 ,  ライフサイクル ,  温帯 ,  *個体群 ,  遺伝 ,  一塩基多型 ,  産卵 ,  生殖隔離 ,  *ゲノム配列 ,  ヨーロッパウナギ
準シソーラス用語： 細分化 ,  Kuma ,  Anguilla anguilla , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ゲノムマッピング ,  遺伝的パッチ ,  一塩基多型 ,  集団ゲノミクス ,  固定指数 ,  絶滅危惧種

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (60件)：

• Aida, K.; Tsukamoto, K.; Yamauchi, K. (Eds.) Eel Biology; Springer: Tokyo, Japan, 2003.
• Aoyama, J. Life history and evolution of migration in Catadromous eels (Genus Anguilla). Aqua-Biosci. Monogr. 2009, 2, 1-42.
• Als, T.D.; Hansen, M.M.; Maes, G.E.; Castonguay, M.; Riemann, L.; Aarestrup, K.; Munk, P.; Sparholt, H.; Hanel, R.; Bernatchez, L. All roads lead to home: Panmixia of European eel in the Sargasso Sea. Mol. Ecol. 2011, 20, 1333-1346.
• Béguer-Pon, M.; Castonguay, M.; Shan, S.; Benchetrit, J.; Dodson, J.J. Direct observations of American eels migrating across the continental shelf to the Sargasso Sea. Nat. Commun. 2015, 6, 8705.
• Wirth, T.; Bernatchez, L. Genetic evidence against panmixia in the European eel. Nature 2001, 409, 1037-1040.

タイトルに関連する用語 (6件)： 日本 ,  ウナギ ,  ゲノム配列 ,  証拠 ,  同所性種分化 ,  支持