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J-GLOBAL ID：201902258463070145   整理番号：19A0966060

novex特異的エキソンスプライシングにおける種間のTTN NOVEXスプライシング変異体の特性化とRBM20の役割【JST・京大機械翻訳】

Characterization of TTN Novex Splicing Variants across Species and the Role of RBM20 in Novex-Specific Exon Splicing

著者 (13件)： Chen Zhilong (College of Animal Science and Technology, Northwest A&F University, Yangling 712100, China) ,  Chen Zhilong (Animal Science, University of Wyoming, Laramie, WY 82071, USA) ,  Song Jiangping (Department of Cardiac Surgery, State Key Laboratory of Cardiovascular Disease, Fuwai Hospital, National Center for Cardiovascular Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100730, China) ,  Chen Liang (Department of Cardiac Surgery, State Key Laboratory of Cardiovascular Disease, Fuwai Hospital, National Center for Cardiovascular Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100730, China) ,  Zhu Chaoqun (Animal Science, University of Wyoming, Laramie, WY 82071, USA) ,  Cai Hanfang (College of Animal Science and Technology, Northwest A&F University, Yangling 712100, China) ,  Cai Hanfang (Animal Science, University of Wyoming, Laramie, WY 82071, USA) ,  Sun Mingming (Animal Science, University of Wyoming, Laramie, WY 82071, USA) ,  Stern Allysa (Prestage Department of Poultry Science, North Carolina State University, Raleigh, NC 27695, USA) ,  Mozdziak Paul (Prestage Department of Poultry Science, North Carolina State University, Raleigh, NC 27695, USA) ,  Ge Ying (Department of Cell and Regenerative Biology, Department of Chemistry, Human Proteomics Program, University of Wisconsin, Madison, WI 53705, USA) ,  Means Warrie J. (Animal Science, University of Wyoming, Laramie, WY 82071, USA) ,  Guo Wei (Animal Science, University of Wyoming, Laramie, WY 82071, USA)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 9  号： 2  ページ： 86  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： タイチン(TTN)は心筋における主要な疾患原因遺伝子である。タイチン(TTN)は,主にRNA結合モチーフ20(RBM20)により調節される選択的スプライシングにより,種々のサイズのTTN蛋白質をコードするヒトにおいて363のエクソンを含む。TTN蛋白質の3つのアイソフォームは,相互排他的エキソン45(11x1),46(11x2),および48(11x3)により生成される。種を横切る11xイソ型の選択的スプライシングと,11xイソ型が心疾患と関連するかどうかは完全に不明である。mVISTAオンラインツールとの交差種エクソン比較により,エキソン45はエキソン46及び48よりも全ての種を通して高度に保存されていることを明らかにした。重要なことに,種を横切るエキソン47と48の間の保存領域を初めて明らかにした。逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)とDNA配列決定は,11x3において48′と命名された新しいエクソンを確認した。加えて,11x1のプライマー対により,イントロン44と45を保存する新しい短縮型を発見した。著者らは,11x2がブタ,マウスおよびラットにおいて発現されないことを発見した。予想外に,3つの短縮型が同定された。イントロン46保持を持つ1つのTTN変異体は主にヒトとカエル心臓で発現し,エキソン45と46の共発現を伴う他の変異体はニワトリとカエル心臓に主に存在し,第3はブタ,マウス,ラット,ニワトリにおいて主に発現した。Rbm20ノックアウトラット心臓を用いて,RBM20が11x変異体のスプライシング調節因子ではないことを明らかにした。さらに,心筋症を伴うヒト心臓における11x変異体の発現レベルは,Novexes2および3が拡張型心筋症(DCM)および/または不整脈性右室心筋症(ARVC)と関連している可能性を示唆した。まとめると,著者らの研究は,種と11x変異体を横切る11xエキソンのスプライシング多様性が心筋症において役割を果たす可能性があることを明らかにする。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 心筋 ,  不整脈 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  ラット ,  RT-PCR法 ,  心臓 ,  選択的スプライシング ,  *キャラクタリゼーション ,  イントロン
準シソーラス用語： 右心室 ,  調節因子 ,  共発現 ,  アイソフォーム ,  コネクチン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： TTN ,  RBM20 ,  Novexアイソフォーム ,  心筋症 ,  選択的スプライシング

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  先天性疾患・奇形一般  (GD03010V)

引用文献 (49件)：

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• Johnson, J.M.; Castle, J.; Garrett-Engele, P.; Kan, Z.; Loerch, P.M.; Armour, C.D.; Santos, R.; Schadt, E.E.; Stoughton, R.; Shoemaker, D.D. Genome-wide survey of human alternative pre-mRNA splicing with exon junction microarrays. Science 2003, 302, 2141-2144.
• Zhu, C.; Chen, Z.; Guo, W. Pre-mRNA mis-splicing of sarcomeric genes in heart failure. Biochim. Biophys. Acta (BBA) Mol. Basis Dis. 2016, 8, 2056-2063.
• Davis, F.J.; Gupta, M.; Pogwizd, S.M.; Bacha, E.; Jeevanandam, V.; Gupta, M.P. Increased expression of alternatively spliced dominant-negative isoform of SRF in human failing hearts. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2002, 282, H1521-H1533.
• Kong, S.W.; Hu, Y.W.; Ho, J.W.; Ikeda, S.; Polster, S.; John, R.; Hall, J.L.; Bisping, E.; Pieske, B.; Dos, R.C.; et al. Heart failure-associated changes in RNA splicing of sarcomere genes. Circ. Cardiovasc. Genet. 2010, 3, 138-146.

タイトルに関連する用語 (3件)： スプライシング変異体 ,  特性化 ,  役割