文献

J-GLOBAL ID：201902258771510774   整理番号：19A2241550

Nrf2ノックアウトマウスのHippocampusにおける環状RNAと長鎖非コードRNAの異なる発現プロファイルと機能予測【JST・京大機械翻訳】

Differential Expression Profiles and Functional Prediction of Circular RNAs and Long Non-coding RNAs in the Hippocampus of Nrf2-Knockout Mice

著者 (8件)： Zhang Run-Jiao (Department of Human Anatomy, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Li Yan (School of Nursing, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Liu Qing (Department of Human Anatomy, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Gao Yan-Jing (Department of Human Anatomy, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Du Juan (Department of Human Anatomy, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Ma Jun (Department of Human Anatomy, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Sun Shao-Guang (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China) ,  Wang Lei (Department of Human Anatomy, Hebei Medical University, Shijiazhuang, China)
資料名： Frontiers in Molecular Neuroscience (Web)  (Frontiers in Molecular Neuroscience (Web))
巻： 12  ページ： 196  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7082A  ISSN： 1662-5099  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:Nrf2(核因子,赤血球2様2)は神経変性疾患において主要な役割を果たすと信じられている。本研究では,Nrf2仲介神経保護と関連した海馬circRNAおよびlncRNA発現プロファイルを検討することを試みた。【方法】Nrf2(-/-)マウスの海馬mRNA,circRNAおよびlncRNA発現プロファイルをマイクロアレイ分析により測定した。特異的に発現したmRNA(DEmRNA),circRNA(DEcircRNA)及びlncRNA(DElncRNA),DEcircRNA-miRNA-DEmRNA相互作用ネットワーク構築,DElncRNA-DEmRNA共発現ネットワーク構築及び生物学的機能アノテーションの同定を含む生物情報学解析を行った。定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)を行い,Nrf2(-/-)マウスの海馬のマイクロアレイデータから誘導されたcircRNAとlncRNAの調節不全発現を検証した。【結果】野生型Nrf2(+/+)マウスと比較して,412のDEmRNA(109の上方および303の下方制御mRNA),1279のDEcircRNA(632の上方および647の下方制御されたcircRNA),および303のDElncRNA(50の上方および253の下方制御されたlncRNA)を,Nrf2(-/-)マウスの海馬において同定した。加えて,qRT-PCR検証結果において,選択されたDEcircRNAとDElncRNAの発現パターンは,一般的にマイクロアレイデータにおける結果と一致した。DEcircRNA-miRNA-DEmRNA相互作用ネットワークにより,mmu_circRNA_44531,mmu_circRNA_34132,mmu_circRNA_45901,mmu_circRNA_34106,mmu_circRNA_008691,mmu_circRNA_003237が,それぞれ47,54,45,57,63,81,121,85,181,および43DEmRNAと競合することを明らかにした。Nrf2(-/-)海馬において,ENSMUST000000125413,NR_028123,uc008nfy.1,AK076764,AK142725,AK080547,およびAK035903は,それぞれ178,89,149,179,142,55および112DEmRNAと共発現した。結論:著者らの研究はNrf2仲介神経保護に関連する重要なcircRNAとlncRNAの探索に寄与する可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ダウンレギュレーション ,  海馬 ,  野生型 ,  アノテーション ,  DNAマイクロアレイ ,  ネットワーク ,  相互作用 ,  *mRNA
準シソーラス用語： *非翻訳RNA ,  マイクロアレイ ,  共発現 ,  マイクロRNA ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  *非翻訳長鎖RNA ,  *NFE2関連因子2 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 環状RNA ,  長い非コードRNA ,  Nrf2 ,  マイクロアレイ ,  神経保護

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (59件)：

• Bartsch T., Wulff P. (2015). The hippocampus in aging and disease: from plasticity to vulnerability. Neuroscience 309 1-16. doi: 10.1016/j.neuroscience.2015.07.084
• Blagosklonny M. V. (2008). Aging: ROS or TOR. Cell Cycle 7 3344-3354. doi: 10.4161/cc.7.21.6965
• Chaudhuri K. R., Odin P. (2010). The challenge of non-motor symptoms in Parkinson’s disease. Prog. Brain Res. 184 325-341. doi: 10.1016/S0079-6123(10)84017-8
• Christie B. R., Kerr D. S., Abraham W. C. (1994). Flip side of synaptic plasticity: long-term depression mechanisms in the hippocampus. Hippocampus 4 127-135. doi: 10.1002/hipo.450040203
• Christie B. R., Schexnayder L. K., Johnston D. (1997). Contribution of voltage-gated Ca2+ channels to homosynaptic long-term depression in the CA1 region in vitro. J. Neurophysiol. 77 1651-1655. doi: 10.1152/jn.1997.77.3.1651

タイトルに関連する用語 (7件)： NRF2 ,  ノックアウトマウス ,  Hippocampus ,  環状RNA ,  長鎖非コードRNA ,  発現プロファイル ,  予測