文献

J-GLOBAL ID：201902258904173985   整理番号：19A2126677

ブラジルからのZoy japonicaからのRhizoctonia solani AG2-2 LPの分離株に存在するマイコウイルスの極端な多様性【JST・京大機械翻訳】

Extreme Diversity of Mycoviruses Present in Isolates of Rhizoctonia solani AG2-2 LP From Zoysia japonica From Brazil

著者 (9件)： Picarelli Maria Aurea S. C. (Plant Virology Laboratory, Instituto Biologico, Sao Paulo, Brazil) ,  Forgia Marco (Department of Life Science and System Biology, University of Turin, Turin, Italy) ,  Forgia Marco (Institute for Sustainable Plant Protection, CNR, Turin, Italy) ,  Rivas Eliana B. (Phytopathological Diagnostic Laboratory, Instituto Biologico, Sao Paulo, Brazil) ,  Nerva Luca (Institute for Sustainable Plant Protection, CNR, Turin, Italy) ,  Nerva Luca (Council for Agricultural Research and Economics-Research Centre for Viticulture and Enology CREA-VE, Conegliano, Italy) ,  Chiapello Marco (Institute for Sustainable Plant Protection, CNR, Turin, Italy) ,  Turina Massimo (Institute for Sustainable Plant Protection, CNR, Turin, Italy) ,  Colariccio Addolorata (Plant Virology Laboratory, Instituto Biologico, Sao Paulo, Brazil)
資料名： Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web)  (Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 244  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7063A  ISSN： 2235-2988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ブラジルにおけるZoysia japonicaは湿潤および寒冷気象条件においてRhizoctonia solani(R.solani)により一般的に感染する。大経路症状から試料から分離したAG2-2LP吻合群に属すると以前に同定されたR.solaniの8分離株をサンパウロ州(ブラジル)の3郡から収集し,ミコウイルスの存在を調べた。全試料における二本鎖RNA(dsRNA)の検出後,in vitro培養菌糸体からのリボソームRNA枯渇全RNAのRNA_Seq分析を行った。47の部分的または完全なウイルス特異的RNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)配列を,陽性センスssRNAウイルスの高い罹患率で得た。配列はBLAST検索における最初の一致とは十分に異なっており,これらの全てが1つの配列を除いて可能な新しいウイルス種であることを示唆した。これらの結果は,アルファパルティウイルスであるRhizoctonia solani dsRNAウイルス2とほぼ完全に一致することを示した。驚くべきことに,推定ウイルスRNAの4つの大きなコンティグはデータベースに存在するウイルスのいかなる既存のクレードにも割り当てられなかったが,DNAはウイルス複製性を確認するこれらのフラグメントに対応して検出されなかった。これは南米におけるR.solani AG2-2LPにおけるミコウイルスの発生に関する最初の報告である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 菌糸 ,  *真菌ウイルス ,  DNA【核酸】 ,  データベース ,  in vitro実験 ,  *Rhizoctonia solani ,  系統発生 ,  RNA【核酸】 ,  培養 ,  *Rhizoctonia ,  rRNA ,  *ブラジル連邦共和国
準シソーラス用語： クレード ,  コンティグ ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： マイコウイルス ,  Rhizoctonia solani ,  草 ,  多発感染症 ,  ウイルス多様性 ,  系統発生解析 ,  ウイルス分類学

分類 (3件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

引用文献 (53件)：

• Andika I. B., Wei S., Cao C., Salaipeth L., Kondo H., Sun L. (2017). Phytopathogenic fungus hosts a plant virus: a naturally occurring cross-kingdom viral infection. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 114, 12267-12272. doi: 10.1073/pnas.1714916114
• Antoniolli D. (2015). “Produção, regularização e conquistas do mercado de gramas cultivadas no Brasil,” in Tópicos atuais em gramados IV, VII SIGRA - Simpósio sobre Gramados. FCA/UNESP. eds Mateus C.M.D'A., Villas Bôas R.L., Andrade T. F., Oliveira M.R., Backes C., Santos A.J.M., Godoy L.J.G. (Botucatu: Editora Fepaf, 9-22. doi: 10.1073/pnas.1714916114
• Bartholomäus A., Wibberg D., Winkler A., Pühler A., Schlüter A., Varrelmann M. (2016). Deep sequencing analysis reveals the mycoviral diversity of the virome of an avirulent isolate of Rhizoctonia solani AG-2-2 IV. PLoS ONE 11:e0165965. doi: 10.1371/journal.pone.0165965
• Bharathan N., Saso H., Gudipati L., Bharathan S., Whited K. (2005). Double-stranded RNA: distribution and analysis among isolates of Rhizoctonia solani AG-2 to-13. Plant Pathol. 54, 196-203. doi: 10.1111/j.1365-3059.2005.01159.x
• Chiba S., Salaipeth L., Lin Y. H. (2009). A novel bipartite double-stranded RNA mycovirus from the white root rot fungus Rosellinia necatrix: molecular and biological characterization, taxonomic considerations, and potential for biological control. J. Virol. 3, 12801-12812. doi: 10.1128/JVI.01830-09

タイトルに関連する用語 (6件)： ブラジル ,  Rhizoctonia ,  LP ,  分離株 ,  マイコウイルス ,  多様性