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J-GLOBAL ID：201902259236474496   整理番号：19A1656170

miRNA発現のトランスクリプトーム解析はLotus(Nelumbo nucifera Gaertn.)における不定根形成への新規洞察を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis of miRNAs expression reveals novel insights into adventitious root formation in lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.)

著者 (4件)： Libao Cheng (School of Horticulture and Plant Protection, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu, People’s Republic of China) ,  Huiying Liu (School of Horticulture and Plant Protection, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu, People’s Republic of China) ,  Yuyan Han (School of Horticulture and Plant Protection, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu, People’s Republic of China) ,  Shuyan Li (College of Guangling, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu, People’s Republic of China)
資料名： Molecular Biology Reports  (Molecular Biology Reports)
巻： 46  号： 3  ページ： 2893-2905  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4741A  ISSN： 1573-4978  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マイクロRNA(miRNA)調節遺伝子発現は種々の植物代謝過程において重要な役割を果たす。不定根はハスにおける植物成長に重要であるが,AR形成におけるmiRNAの役割は不明のままである。miRNAの発現プロファイリングは,ハスにおけるARの3つの異なる発生段階の間に行われた:AR段階の誘導,ARの初期段階,およびARsの最大数。これらのデータは,ハイスループットタグ配列決定を通してすでに同定されたように,全体のハスゲノムで参照されている。1.3×10~7タグが達成され,そのうちの11,035,798,11,436,062,および12542,392のクリーンタグが各段階から得られた。miRNA分析は,miRNAがすべての小RNAの間で10%未満であることを明らかにした。全部で,310のmiRNA(240の上方制御と70の下方制御miRNA)は,発現が誘導段階から初期段階に変化することを示した。さらに,140miRNAの発現は増加し,123miRNAの発現は初期と最大AR段階の間で減少し,大部分は~-4倍であった。代謝経路に関与するmiRNAは,初期段階/無誘導段階と最大数段階/初期段階の間で異なった。初期段階/無誘導段階におけるいくつかのmiRNAは植物ホルモン代謝とピルビン酸およびMAPK経路に関連し,一方,最大数段階/初期段階における主要miRNAは炭水化物代謝に関与した。初期段階から最大段階へのAR形成に関連するすべての差別的に発現したmiRNAも分析した。16のmiRNAの発現をqRT-PCRを用いて測定した。本研究は,ハスにおけるAR形成時のmiRNA調節に関する一般的洞察を提供する。Copyright 2019 Springer Nature B.V. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 代謝経路 ,  *遺伝子 ,  アップレギュレーション ,  糖質代謝 ,  遺伝子発現 ,  植物ホルモン ,  代謝 ,  植物成長 ,  ダウンレギュレーション ,  脂肪族ケトン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ケト酸
準シソーラス用語： 低分子RNA ,  プロファイリング ,  *不定根 ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ロータス ,  不定根 ,  miRNA ,  遺伝子 ,  発現

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： ピルビン酸

タイトルに関連する用語 (6件)： miRNA ,  発現 ,  トランスクリプトーム解析 ,  Lotus ,  根形成 ,  洞察