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J-GLOBAL ID：201902259440576098   整理番号：19A0780534

Plasmodium falciparumにおける乳酸デヒドロゲナーゼ遺伝子の包括的配列多様性【JST・京大機械翻訳】

Global sequence diversity of the lactate dehydrogenase gene in Plasmodium falciparum

著者 (4件)： Simpalipan Phumin (Zoology Ph.D. Programme, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand) ,  Pattaradilokrat Sittiporn (Department of Biology, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand) ,  Pattaradilokrat Sittiporn (Veterinary Parasitology Research Group, Department of Pathology, Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand) ,  Harnyuttanakorn Pongchai (Department of Biology, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand)
資料名： Malaria Journal (Web)  (Malaria Journal (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 16  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7332A  ISSN： 1475-2875  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 抗原検出迅速診断試験(RDT)は,マラリア事例管理を改善するために,遠隔地域での使用のための世界保健機関によって推奨されている。Plasmodium falciparumの乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)は,種々の商業的RDTにより使用される主要な寄生虫抗原の1つである。LDHに基づくRDTの貧弱な検出は,遺伝子の配列多様性に部分的に起因すると仮定されている。これを試験するために,本研究はタイ国におけるP.falciparum ldh遺伝子の遺伝的多様性を調査し,世界中のP.falciparum個体群におけるLDH配列多様性の地図を構築することを目的とした。ldh遺伝子は,世界中のP.falciparum集団からの数百の配列と比較してタイ国の50のP.falciparum分離株に対して配列決定された。多形部位の割合,平均ヌクレオチド多様性指数(π),ハプロタイプ多様性指数(H)を含むいくつかの分子変異指標を計算した。陽性選択と中立性試験の試験を行い,遺伝子上の自然淘汰の特徴を決定した。進化的関係を推論するために,Plasmodium ldhの種間および種間の平均遺伝距離を分析した。P.falciparum ldhのヌクレオチド配列は,LDHの5つのアイソフォームをコードする9つの対立遺伝子に分類できた。L1aは最も一般的な対立遺伝子型であり,世界中のP.falciparum個体群に分布していた。Plasmodium falciparum ldh配列は高度に保存され,ハプロタイプとヌクレオチドの多様性はそれぞれ0.203と0.0004であった。極端に低い遺伝的多様性は,機能的制約により,選択を精製することにより維持された。系統発生分析は,他のヒトマラリア寄生虫よりもむしろ,P.falciparumのマラリア寄生虫に対する密接な遺伝的関係を推測した。本研究は,P.falciparumにおけるldh遺伝子の全体的遺伝的変異を明らかにし,LDHベースRDTの検出を改善し,治療薬標的としてLDHのカンジダ性を支持する知識を提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 抗原 ,  ヌクレオチド配列 ,  Candida ,  *遺伝 ,  寄生虫 ,  変異 ,  *マラリア原虫 ,  ハプロタイプ ,  個体群 ,  ヌクレオチド ,  *Plasmodium falciparum ,  マラリア ,  *遺伝子 ,  対立遺伝子
準シソーラス用語： アイソフォーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 遺伝的多様性 ,  DNAシークエンシング ,  乳酸デヒドロゲナーゼ ,  迅速診断試験 ,  マラリア ,  純化の選択

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症の診断  (GD01020S) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (55件)：

• Am J Trop Med Hyg; Performance of the OptiMAL test for malaria diagnosis among suspected malaria patients at the rural health centers; J Iqbal, A Munneer, N Khalid, MA Ahmed; 68; 2003; 624-628; 10.4269/ajtmh.2003.68.624; citation_id=CR1
• J Clin Microbiol; Evaluation of the OptiMAL test for rapid diagnosis of Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum malaria; CJ Palmer, LF Lindo, WI Klaskala, JA Quesada, R Kaminsky, MK Baum; 36; 1998; 203-206; citation_id=CR2
• Am J Trop Med Hyg; Immuncapture diagnosis assays for malaria using Plasmodium lactate dehydrogenase (pLDH); R Piper, J Lebras, L Wentworth, A Hunt-Cooke, S Houze, P Chiodini; 60; 1999; 109-118; 10.4269/ajtmh.1999.60.109; citation_id=CR3
• Am J Trop Med Hyg; Diagnosis of imported malaria by Plasmodium lactate dehydrogenase (pLDH) and histidine-rich protein 2 (PfHRP-2)-based immunocapture assays; J Iqbal, PR Hira, A Sher, A Al-Enezi; 64; 2001; 20-23; 10.4269/ajtmh.2001.64.20; citation_id=CR4
• Trop Med Int Health.; Comparison of three antigen detection methods for diagnosis and therapeutic monitoring of malaria: a field study from southern Vietnam; NM Huong, TME Davis, S Hewitt, NV Huong, TT Uyen, DH Nhan; 7; 2002; 304-308; 10.1046/j.1365-3156.2002.00869.x; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： Plasmodium ,  乳酸デヒドロゲナーゼ ,  遺伝子 ,  多様性