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J-GLOBAL ID：201902259963099374   整理番号：19A1587910

体重のゲノムワイド関連分析はニジマス(Oncorhynchus mykiss)における発生と代謝に関連する候補遺伝子を同定する【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide association analysis for body weight identifies candidate genes related to development and metabolism in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

著者 (8件)： Reis Neto Rafael Vilhena (Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias, Universidad de Chile, La Pintana, Santiago, Chile) ,  Reis Neto Rafael Vilhena (Departamento de Engenharia de Pesca, Campus Experimental de Registro, Universidade Estadual Paulista “Julio de Mesquita Filho”, Registro, SP, Brazil) ,  Yoshida Grazyella Massako (Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias, Universidad de Chile, La Pintana, Santiago, Chile) ,  Yoshida Grazyella Massako (School of Agricultural and Veterinarian Sciences, Sao Paulo State University (Unesp), Jaboticabal, Jaboticabal, Brazil) ,  Lhorente Jean Paul (Benchmark Genetics Chile S.A., Puerto Montt, Chile) ,  Yanez Jose Manuel (Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias, Universidad de Chile, La Pintana, Santiago, Chile) ,  Yanez Jose Manuel (Benchmark Genetics Chile S.A., Puerto Montt, Chile) ,  Yanez Jose Manuel (Nucleo Milenio INVASAL, Concepcion, Chile)
資料名： Molecular Genetics and Genomics  (Molecular Genetics and Genomics)
巻： 294  号： 3  ページ： 563-571  発行年： 2019年 
JST資料番号： C0025C  ISSN： 1617-4615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 成長は水産養殖種における生理学的および経済的観点から最も重要な形質の1つである。このように,この形質の遺伝的変異を支えるゲノム領域と遺伝子を同定することは,ニジマスを含むいくつかの魚種において特に興味がある。本研究では,チリの繁殖個体群に属する105の完全同胞系統からの高密度SNPパネル(57k)と4596遺伝子型ニジマスを用いて,標識化(BWT)と18か月(BW18M)に関連するゲノム領域を同定するために,ゲノムワイド関連研究(GWAS)を行った。分析は,一段階GBLUPアプローチにより行った。全ゲノムにわたる20の隣接SNPウインドウにより説明される遺伝的分散を報告した。候補遺伝子をさらに調べるために,各形質に対する10番目の染色体における遺伝的変異の最も高い割合を説明するウインドウに焦点を当てた。トップ10染色体からの主要なウィンドウを,標的ヌクレオチド配列を決定するために,各ウインドウの最初と最後のSNP位置を用いてBLASTにより探索した。予想されるように,窓によって説明される遺伝的分散の割合は,体重の多遺伝子的性質のために比較的低かった。BWTとBW18Mに対する最も重要なゲノム領域は染色体15と24に位置し,それぞれの形質に対する遺伝的分散の2.14%と3.02%を説明した。いくつかの成長因子を含む候補遺伝子,骨格筋および骨組織の発生に関与する遺伝子,および栄養代謝を,BWTおよびBW18Mの両方に対する関連領域内で同定した。これらの結果は,体重がニジマスにおいて自然に多遺伝子性であることを示し,最も重要な遺伝子座は形質に対する遺伝的分散の3%を説明している。ここで同定された遺伝子は,ニジマスにおける成長のための変動の基礎となる生物学的機構を明らかにするための更なる機能的検証のための良好な候補を示す。Copyright 2019 Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,  *ニジマス ,  染色体 ,  *ゲノム ,  養殖 ,  *体重 ,  *代謝 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  標識法 ,  個体群 ,  *遺伝 ,  繁殖行動 ,  *遺伝子 ,  遺伝子型
準シソーラス用語： *候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 候補遺伝子 ,  成長 ,  GWAS ,  SNP ,  筋肉と骨の発達 ,  栄養素代謝

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 体重 ,  ゲノム ,  分析 ,  ニジマス ,  Oncorhynchus ,  代謝 ,  候補遺伝子 ,  同定