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J-GLOBAL ID：201902260052653745   整理番号：19A2215299

胃癌のmiRNAバイオマーカー同定のためのmiRNA-seqの多視点データのゲノムワイド解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide analysis of multi-view data of miRNA-seq to identify miRNA biomarkers for stomach cancer

著者 (5件)： Pant Namrata (Department of Bioscience and Bioengineering, Indian Institute of Technology, Jodhpur, India) ,  Rakshit Somnath (Department of Computer Science and Engineering, National Institute of Technical Teachers’ Training and Research, Kolkata, India) ,  Rakshit Somnath (Laboratory of Functional and Structural Genomics, Center of New Technologies, University of Warsaw, Warsaw, Poland) ,  Paul Sushmita (Department of Bioscience and Bioengineering, Indian Institute of Technology, Jodhpur, India) ,  Saha Indrajit (Department of Computer Science and Engineering, National Institute of Technical Teachers’ Training and Research, Kolkata, India)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 97  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 胃癌は世界中の癌関連死の主要原因の1つである。この癌の80%以上の診断は,低い5年生存率をもたらす後期に起こる。これは胃癌に対するより良い予後技術を持つ必要性を強調する。これに関して,全ゲノムのNext-generation sequencingとomicsに対する多視点アプローチは,miRNAのハイスループット発現データを用いて,胃癌の基礎となる分子複雑性を明らかにする可能性がある。一般に,miRNAは小さく,非コードRNAであり,標的mRNAのダウンレギュレーションを引き起こす。それらはまた,胃癌のステージまたは組織型のような特異的な生物学的状態に対する異なる発現を示し,潜在的バイオマーカーとしてのそれらの重要性を強調する。miRNA発現データを分析することは,多数のmiRNAと少ないサンプルサイズの存在のために困難な仕事である。小セットのmiRNAは,効率的な診断および予後ツールの設計に役立つであろう。これに関して,ここでは,臨床転帰の5つの異なるカテゴリー,すなわち条件,臨床段階,年齢,組織学的タイプおよび生存状態に対して異なるセットのmiRNAを選択する計算フレームワークを提案した。最初に,miRNAを4つの特徴ランキング法を用いてランク付けした。これらのランクを用いて,適応重みに基づくアンサンブルランクを見出した。第2に,各カテゴリーからのトップ100miRNAを用いて,すべてのカテゴリーに共通するmiRNAと1つのカテゴリーのみに属するmiRNAを見出した。最後に,結果を定量的および生物学的有意性分析により検証した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予後 ,  等級づけ ,  死 ,  ダウンレギュレーション ,  mRNA ,  *バイオマーカー ,  *胃腫瘍 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： 次世代シークエンシング ,  転帰 ,  組織型 ,  非翻訳RNA ,  複雑性 ,  ハイスループット ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アンサンブルランキング ,  特徴選択 ,  miRNA ,  次世代シークエンシング ,  胃癌

分類 (2件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： 胃癌 ,  miRNA ,  バイオマーカー ,  同定 ,  視点 ,  ゲノム ,  解析