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J-GLOBAL ID：201902260371449532   整理番号：19A0625301

Nanoarchaeum equitans由来のglycyL-tRNAシンテターゼ:古細菌GlyrSの最初の結晶構造とそのtRNAグリコシル化の解析【JST・京大機械翻訳】

Glycyl-tRNA synthetase from Nanoarchaeum equitans: The first crystal structure of archaeal GlyRS and analysis of its tRNA glycylation

著者 (17件)： Fujisawa Alma (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Toki Risako (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Miyake Hideaki (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Shoji Tomoko (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Doi Hiromi (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Hayashi Hiromi (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Hanabusa Rina (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Mutsuro-Aoki Hiromi (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Umehara Takuya (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Ando Tadashi (Department of Applied Electronics, Tokyo University of Science, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Ando Tadashi (Research Institute for Science and Technology, Tokyo University of Science, 2641 Yamazaki, Noda, Chiba 278-8510, Japan) ,  Noguchi Hiroki (Drug Design Laboratory, Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 1-7-29 Suehiro, Tsurumi-ku, Yokohama 230-0045, Japan) ,  Noguchi Hiroki (Laboratory of Biomolecular Modelling and Design, Department of Chemistry, KU Leuven, Celestijnenlaan 200G-bus2403, 3001 Leuven, Belgium) ,  Voet Arnout (Laboratory of Biomolecular Modelling and Design, Department of Chemistry, KU Leuven, Celestijnenlaan 200G-bus2403, 3001 Leuven, Belgium) ,  Park Sam-Yong (Drug Design Laboratory, Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 1-7-29 Suehiro, Tsurumi-ku, Yokohama 230-0045, Japan) ,  Tamura Koji (Department of Biological Science and Technology, Tokyo University of Science, 6-3-1 Niijuku, Katsushika-ku, Tokyo 125-8585, Japan) ,  Tamura Koji (Research Institute for Science and Technology, Tokyo University of Science, 2641 Yamazaki, Noda, Chiba 278-8510, Japan)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 511  号： 2  ページ： 228-233  発行年： 2019年 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,NanoarchaeumequitansのグリシルtRNAシンテターゼ(GlyRS)のX線結晶構造を報告する。これは最初の古細菌GlyRS結晶構造である。GlyRSはN末端触媒ドメインとこれらドメイン間に挿入された長いβシートを持つC末端アンチコドン結合ドメインから成る。野生型N.equitans tRNA-Glyの非修飾転写物は,GlyRSを用いて成功裏にグリコシル化された。他のヌクレオチドによるtRNA-Glyの識別子塩基A73の置換は,グリコシル化活性の有意な減少を引き起こした。tRNA-Glyの受容体幹の第二塩基対C2G71の変異解析は,GlyRSによる認識のための同一要素として,塩基対,特にG71の重要性を明らかにした。tRNA-Gly G71置換変異体とArg223をアラニンに変異させたGlyRS変異体を用いたグリシル化アッセイは,G71の位置6のカルボニル酸素がN.equitans GlyRSのArg223のグアニジン窒素と水素結合する可能性を強化した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  ヌクレオチド ,  受容体 ,  *合成酵素 ,  酸素 ,  *tRNA ,  *グリコシル化 ,  β構造 ,  結合部位 ,  *古細菌 ,  アンチコドン ,  野生型 ,  カルボニル基 ,  *結晶構造 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン

著者キーワード (6件)： tRNA ,  glycyL-tRNAシンテターゼ ,  Nanoarchaeum Equitans ,  結晶構造 ,  アクセプタ-ステム認識 ,  アミノアシル化

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： アラニン

タイトルに関連する用語 (6件)： tRNA ,  シンテターゼ ,  古細菌 ,  結晶構造 ,  グリコシル化 ,  解析