文献

J-GLOBAL ID：201902260530295638   整理番号：19A1348866

マングローブ堆積物からのマラカイトグリーン分解遺伝子ファミリーと酵素のメタゲノミクスに基づく発見【JST・京大機械翻訳】

Metagenomics-Based Discovery of Malachite Green-Degradation Gene Families and Enzymes From Mangrove Sediment

著者 (5件)： Qu Wu (School of Life Sciences, Xiamen University, Xiamen, China) ,  Liu Tan (College of Ocean and Earth Sciences, Xiamen University, Xiamen, China) ,  Wang Dexiang (College of Ocean and Earth Sciences, Xiamen University, Xiamen, China) ,  Hong Guolin (The Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Xiamen University, Xiamen, China) ,  Zhao Jing (College of Ocean and Earth Sciences, Xiamen University, Xiamen, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 2187  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マラカイトグリーン(MG)は有機汚染物質であり,MGによる排水は沿岸と海洋生態系の健康とバランスに負の影響を及ぼす。マングローブに生息する多様で豊富な微生物群集は様々な生態学的プロセスに積極的に関与している。マングローブ堆積物からのメタゲノム配列決定を適用して,資源MG分解遺伝子(MDGs)を発掘し,それらの対応する酵素の可能性を評価した。10GBのデータセットを33,756コンティグに組み立て,44,743ORFsを予測した。データセットにおいて,666の細菌属と13の汚染物質分解経路を見つけた。ProteobacteriaとActinobacteriaは分類学的割当において最も優勢な門であった。全部で44の推定MDGsが明らかになり,おそらく30の細菌属から由来し,そのほとんどはProteobacteriaとBacteroidetes門に属していた。MDGsはペルオキシダーゼ遺伝子(全MDGsの93.54%まで),ラッカーゼ(3.40%)及びp450(3.06%)を含む3つの遺伝子ファミリーに属した。3つの遺伝子ファミリーのうち,GenBankにおける最も近い配列とより低い類似性を持つ3つの代表(Mgv-rLACC,Mgv-rPOD,およびMgv-rCYP)を原核生物発現し,それらの酵素を特性化した。3つの組換え蛋白質は異なるMG分解活性を示した。Mgv-rPODは最も強い活性を有し,40分以内にMG(300mg/L)の97.3%を脱色した。加えて,Mgv-rPODは,LC-MSによって検出された中間体に従って,他の2つの組換え蛋白質と比較して,MG分解のより完全なプロセスを示した。さらに,高いMG分解活性は,低温(20°C),広いpH範囲,および金属イオンとキレート剤の存在において維持された。また,Mgv-rLACCとMgv-rCYPは,それぞれ,24時間以内にMG(20mg/L)の63.7%と54.1%を除去した。結果は,豊富な遺伝資源を発見するための広い洞察と,沿岸汚染を防ぐための環境に優しい方法にアクセスするための効果的な戦略を提供することができた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： LC-MS分析 ,  *遺伝子 ,  *マングローブ ,  *堆積物 ,  *酵素 ,  沿岸 ,  キャラクタリゼーション ,  細菌 ,  金属イオン ,  芳香族アミン ,  ポリエン ,  キノイド化合物 ,  インモニウム ,  エノン ,  脂環式ケトン ,  第三アミン
準シソーラス用語： ラッカーゼ ,  プロテオバクテリア ,  メタゲノム ,  有機汚染物質 ,  *メタゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： マングローブ堆積物 ,  メタゲノム ,  Mgの生物分解 ,  遺伝子発現 ,  生化学分析 ,  分解経路

分類 (3件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： マラカイトグリーン

引用文献 (59件)：

• Algubury H. (2016). The effect of coupled titanium dioxide and cobalt oxide on photo catalytic degradation of malachite green. Int. J. Chemtech Res. 9 227-235.
• Amann R. I., Binder B. J., Olson R. J., Chisholm S. W., Devereux R., Stahl D. A. (1990). Combination of 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes with flow cytometry for analyzing mixed microbial populations. Appl. Environ. Microbiol. 56 1919-1925.
• Andreote F. D., Jiménez D. J., Chaves D., Dias A. C., Luvizotto D. M., Diniandreote F., et al (2012). The microbiome of Brazilian mangrove sediments as revealed by metagenomics. PLOS One 7:e38600. doi: 10.1371/journal.pone.0038600
• Cha C. J., Doerge D. R., Cerniglia C. E. (2001). Biotransformation of malachite green by the fungus Cunninghamella elegans. Appl. Environ. Microbiol. 67 4358-4360. doi: 10.1128/AEM.67.9.4358-4360.2001
• Chang G. R., Chen H. S., Lin F. Y. (2016). Analysis of banned veterinary drugs and herbicide residues in shellfish by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC/MS/MS) and gas chromatography-tandem mass spectrometry (GC/MS/MS). Mar. Pollut. Bull. 113 579-584. doi: 10.1016/j.marpolbul.2016.08.080

タイトルに関連する用語 (8件)： マングローブ ,  堆積物 ,  マラカイトグリーン ,  分解 ,  遺伝子ファミリー ,  酵素 ,  メタゲノミクス ,  発見