細菌DNA損傷応答蛋白質UmuDの二量体交換界面の同定【JST・京大機械翻訳】

Murison David A.; Timson Rebecca C.; Koleva Bilyana N.; Ordazzo Michael; Beuning Penny J.

文献

J-GLOBAL ID：201902260550691216 整理番号：19A1806498

細菌DNA損傷応答蛋白質UmuDの二量体交換界面の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of the Dimer Exchange Interface of the Bacterial DNA Damage Response Protein UmuD

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資料名：
巻： 56 号： 36 ページ： 4773-4785 発行年： 2017年
JST資料番号： B0270B ISSN： 0006-2960 CODEN： BICHAW 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

誘導されたDNA損傷応答経路である大腸菌SOS応答は,正確な修復機構を提供することにより,細菌細胞上での生存を混乱させ,潜在的に変異原性経路経病変合成(TLS)をもたらす。umuD遺伝子産物はDNA損傷後にアップレギュレーションされ,SOS応答の非変異原性及び変異原性の両方において役割を果たす。全長UmuDは139アミノ酸サブユニットのホモ二量体として発現し,最終的にそのN末端24アミノ酸を切断してUmuD′を形成する。切断産物UmuD′とUmuCは,TLSを実行することができるYファミリーポリメラーゼDNA Pol V(UmuD′_2C)を形成する。UmuDとUmuD′はホモ二量体として存在するが,それらのサブユニットは容易に交換してUmuDD′ヘテロ二量体を優先的に形成することができる。ヘテロ二量体形成はUmuD′の分解経路における必須段階である。ClpXPプロテアーゼに対する認識配列は完全長UmuDの最初の24アミノ酸内に位置し,UmuDまたはUmuD′がClpXPにより分解されるかどうかは完全長UmuDのパートナーである。UmuDサブユニットが交換する機構をより良く理解するために,Foerster共鳴エネルギー移動により検出された多数の蛍光標識単一システインUmuD変異体の交換速度を測定した。二量体界面近傍の標識部位は交換速度の増加と相関し,二量体界面の弱化は交換を促進するが,外部の標識部位は交換速度を低下させることを示した。ほとんどの場合,ホモ二量体とヘテロ二量体交換は類似の速度を示し,いくらか異なる分子表面がホモ二量体交換とヘテロ二量体形成を仲介することを示した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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酵素一般

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