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J-GLOBAL ID：201902260629561636   整理番号：19A1889031

アルカンチオール自己集合単分子層シミュレーションのための生体分子力場の比較【JST・京大機械翻訳】

Comparison of Biomolecular Force Fields for Alkanethiol Self-Assembled Monolayer Simulations

著者 (2件)： Bhadra Pratiti (Department of Computer and Information Science, University of Macau, Macau) ,  Siu Shirley W. I. (Department of Computer and Information Science, University of Macau, Macau)
資料名： Journal of Physical Chemistry C  (Journal of Physical Chemistry C)
巻： 121  号： 47  ページ： 26340-26349  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1877A  ISSN： 1932-7447  CODEN： JPCCCK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子動力学シミュレーションにおける蛋白質と脂質膜の特性を表すために,合理的な全原子または単一原子生体分子力場を開発した。しかし,それらは自己集合単分子層(SAM)に対してパラメータ化されていないので,SAMおよび蛋白質-SAM系のシミュレーションにおけるそれらの有用性は確認されていない。ここでは,短鎖から長鎖(C10-C18)のアルカンチオールSAMをシミュレートするために,6つの一般的な生体分子力場,Lipid14,GAFF,L-OPLS,CHARMM36,S脂質およびGROMOS54a7を比較した。著者らの結果は,これらの力場のどれも,傾斜角とねじれ角の鎖長依存性を再現しないことを示した。SAM上の液滴接触角はすべての力場によって良く表されるが,GAFFとLipid14は実験値に合理的に近い相転移温度をもたらす。全体として,著者らの包括的比較は,GAFFとLipid14がSAMシミュレーションのためのより良い選択であることを示唆した。SAMに対する力の場パラメータの更なる改善が必要である。(152語)。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  *力の場 ,  パラメタリゼーション ,  タンパク質 ,  脂質 ,  *シミュレーション ,  傾斜角 ,  長鎖 ,  接触角
準シソーラス用語： 鎖長依存性 ,  ねじれ角 ,  単一原子 ,  分子動力学シミュレーション ,  *生体分子 ,  *自己集合単分子膜 ,  *アルカンチオール , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 吸着の電子論  (CB12042Y) ,  固-液界面  (CB12050B)

タイトルに関連する用語 (4件)： アルカンチオール ,  自己集合単分子層 ,  シミュレーション ,  生体