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J-GLOBAL ID：201902260790064486   整理番号：19A1805169

デジタルPCRのためのモデルベースの分類:雨のためのあなたの傘【JST・京大機械翻訳】

Model-Based Classification for Digital PCR: Your Umbrella for Rain

著者 (12件)： Jacobs Bart K. M. (Department of Applied Mathematics, Computer Science and Statistics, Ghent University, Belgium) ,  Goetghebeur Els (Department of Applied Mathematics, Computer Science and Statistics, Ghent University, Belgium) ,  Vandesompele Jo (Center for Medical Genetics Ghent (CMGG), Ghent University, Belgium) ,  Vandesompele Jo (Biogazelle, Belgium) ,  Vandesompele Jo (Bioinformatics Institute Ghent From Nucleotides to Networks (Big N2N), Ghent University, Belgium) ,  De Ganck Ariane (Biogazelle, Belgium) ,  Nijs Nele (Biogazelle, Belgium) ,  Beckers Anneleen (Biogazelle, Belgium) ,  Papazova Nina (Scientific Institute of Public Health (WIV-ISP), Belgium) ,  Roosens Nancy H. (Scientific Institute of Public Health (WIV-ISP), Belgium) ,  Clement Lieven (Department of Applied Mathematics, Computer Science and Statistics, Ghent University, Belgium) ,  Clement Lieven (Bioinformatics Institute Ghent From Nucleotides to Networks (Big N2N), Ghent University, Belgium)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 89  号： 8  ページ： 4461-4467  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： デジタルPCRのための標準データ分析パイプラインは,自動化されたハード閾値を用いて,平行マイクロPCR反応の終点蛍光をデジタル化することにより,標的核酸の濃度を推定する。誤分類は濃度推定に大きな影響を持ち,実質的に精度を低下させることが知られているが,この分類の不確実性は典型的に無視されている。著者らは,モデルベースのクラスタリング法を導入して,ターゲットが存在する確率(不在)を,観測された蛍光と非テンプレート制御サンプルにおける分布形状に関する分割条件において存在させた(不在)。この方法論は,分類の固有の不確実性を認識し,個々の分配レベルとグローバル濃度レベルの両方において,精度の自然測度を提供する。遺伝的に修飾された生物,阻害,ダイナミックレンジ,および突然変異検出実験に関する著者らの方法を例示する。この方法は,精度のより現実的な測度とともに,現行の標準よりも類似の精度またはより良い濃度推定を提供することを示した。個々の分割確率と診断密度プロットは,さらにいくつかの品質管理を可能にする。Umbellaと呼ばれる著者らの方法のR実施は利用可能であり,絶対dPCR定量化のためのより客観的で自動化されたデータ分析手順を提供する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データ解析 ,  PCR法 ,  ダイナミックレンジ ,  診断 ,  *測度 ,  遺伝 ,  品質管理 ,  不確実性 ,  自動化 ,  蛍光
準シソーラス用語： 変異解析 ,  ディジタル化 ,  エンドポイント ,  *モデルベース ,  *ディジタルPCR , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  バイオアッセイ  (EA03060N)

タイトルに関連する用語 (5件)： デジタルPCR ,  モデルベース ,  分類 ,  雨 ,  傘