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J-GLOBAL ID：201902262310040899   整理番号：19A1549691

ジャスモン酸メチルに対する応答におけるEuphorbia kansuiのマイクロRNAプロファイル【JST・京大機械翻訳】

MicroRNAome Profile of Euphorbia kansui in Response to Methyl Jasmonate

著者 (8件)： Li Peng (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China) ,  Tian Zheni (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China) ,  Zhang Qing (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China) ,  Zhang Yue (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China) ,  Wang Meng (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China) ,  Fang Xiaoai (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China) ,  Shi Wenjing (Shaanxi Pharmaceutical Holding Group Co., Ltd., Xi’an 710069, China) ,  Cai Xia (Key Laboratory of Resource Biology and Biotechnology in Western China, Ministry of Education, Northwest University, Xi’an 710069, China)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 20  号： 6  ページ： 1267  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： miRNAは異なる植物発生段階および生物的および非生物的ストレスに対する植物応答において重要な調節的役割を果たしている。しかしながら,情報はジャスモン酸メチル(MeJA)に対するmiRNA調節機構に限定されている。本研究では,Illina RNA-Seqによるジャスモン酸メチル(MeJA)に対する応答におけるEuphorbia kansuiの関連する調節機構を明らかにするために,マイクロRNAomeプロファイルを用いた。結果として,11,277の標的mRNAに対応する875のmiRNAを同定し,それらの間で,6019の標的mRNA配列を表す168の既知miRNAファミリーを得た。452miRNA-mRNA対は抗相関性を示した(相関0.05のCor<0.50とp値)。一対比較において,折畳み変化2およびp(p-値)<0.05を有するmiRNAは,有意差次的に発現したmiRNA(DEMs)と同定された。0,24,36および48時間のMeJA処理におけるDEMsを,短時間発現Miner(STEM)クラスタを用いて比較し,4つの有意な遺伝子プロファイル(p値0.02)を同定した。すべてのmiRNA標的に関する遺伝子とゲノム(KEGG)経路と遺伝子オントロジー(GO)濃縮分析のkyoto encyclopediaを通して,MeJA処理下のmiRNAによって調節された。その結果,miRNAはE.kansuiの調節機構を説明するのに非常に有用な情報を提供し,非モデル植物のMeJAストレスに対するmiRNA応答の全体的見解を提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： mRNA ,  *トウダイグサ属 ,  *RNA【核酸】 ,  クラスタ ,  遺伝子 ,  折畳み ,  オレフィン化合物 ,  脂環式ケトン ,  ケトエステル
準シソーラス用語： モデル植物 ,  遺伝子オントロジー ,  KEGG ,  遺伝子発現プロファイリング ,  一対比較 ,  p値 ,  非生物的ストレス ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Euphorbia kansui ,  ジャスモン酸メチル ,  マイクロRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： ジャスモン酸メチル

引用文献 (59件)：

• Zhang, Q.; Zhou, Q.R.; Lou, J.W.; Chen, P.D.; Yao, W.F.; Tao, W.W.; Tang, Y.P.; Dai, G.C.; Wang, K.; Zhang, L. Chemical Constituents from Euphorbia kansui. Molecular 2017, 22, 2176.
• Zheng, W.F.; Cui, Z.; Zhu, Q. Cytotoxicity and antiviral activity of the compounds from Euphorbia kansui. Planta Med. 1998, 64, 754-756.
• Li, X.R.; Zhang, Y.D.; Tang, H.H. Study of auxiliary therapeutic effect of kansui root on patients with severe acute pancreatitis. China J. Mod. Med. 2002, 12, 7-9.
• Yan, X.; Zhang, L.; Guo, J.; Cao, Y.; Shang, E.; Tang, Y.; Ding, A.; Duan, J.A. Processing of kansui roots stir-baked with vinegar reduces kansui-induced hepatocyte cytotoxicity by decreasing the contents of toxic terpenoids and regulating the cell apoptosis pathway. Molecular 2014, 19, 7237-7254.
• Hsieh, W.T.; Lin, H.Y.; Chen, J.H.; Kuo, Y.H.; Fan, M.J.; Wu, R.S.; Wu, K.C.; Wood, W.G.; Chung, J.G. Latex of euphorbia antiquorum induces apoptosis in human cervical cancer cells via c-jun n-terminal kinase activation and reactive oxygen species production. Nutr. Cancer 2011, 63, 1339-1347.

タイトルに関連する用語 (5件)： ジャスモン酸メチル ,  応答 ,  Euphorbia ,  マイクロRNA ,  プロファイル