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J-GLOBAL ID：201902262499698002   整理番号：19A0488589

部分剛性高分子のサンプリング並進/回転のための力場グリッドの使用【JST・京大機械翻訳】

Using Force-Field Grids for Sampling Translation/Rotation of Partially Rigid Macromolecules

著者 (1件)： Mezei Mihaly (Department of Pharmacological Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY 10029, USA)
資料名： Algorithms (Web)  (Algorithms (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 6  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7130A  ISSN： 1999-4893  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 柔軟な部分と剛体部分の間の相互作用が各マクロ分子の剛体部分に関連するエネルギー格子によって表現される2つの部分的に柔軟な高分子のシミュレーションのためのアルゴリズムを提示した。提案したアルゴリズムは,柔軟な部分を変換する有意に少ない効果を犠牲にして,分子運動におけるグリッドの変換を回避する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *並進 ,  *剛性 ,  相互作用 ,  分子運動 ,  剛体 ,  アルゴリズム ,  *力の場 ,  *高分子

著者キーワード (4件)： 力場グリッド ,  蛋白質ループ ,  モンテカルロ法 ,  部分的に柔軟な分子

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (7件)：

• Mezei, M. On the potential of Monte Carlo methods for simulating macromolecular assemblies. In Third International Workshop for Methods for Macromolecular Modeling Conference Proceedings; Gan, H.H., Schlick, T., Eds.; Springer: New York, NY, USA, 2002.
• Jorgensen, W.L.; Tirado-Rives, J. Molecular modeling of organic and biomolecular systems using BOSS and MCPRO. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1689-1700.
• Ullmann, R.T.; Ullmann, G.M. GMCT: A Monte Carlo simulation package for macromolecular receptors. J. Comput. Chem. 2012, 33, 887-900.
• Mezei, M. MMC: Monte Carlo Program for Molecular Assemblies. Available online: http://inka.mssm.edu/~mezei/mmc (accessed on 27 December 2016).
• Goodford, P.J. A computational procedure for determining energetically favorable binding sites on biologically important macromolecules. J. Med. Chem. 1985, 28, 849-857.

タイトルに関連する用語 (6件)： 剛性 ,  高分子 ,  サンプリング ,  並進 ,  力場 ,  グリッド