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J-GLOBAL ID：201902262659653014   整理番号：19A0788539

ゲノム構成とクロマチン分析は発生B細胞における加齢の特徴としてのインシュリン様成長因子シグナル伝達の転写ダウンレギュレーションを同定する【JST・京大機械翻訳】

Genome organization and chromatin analysis identify transcriptional downregulation of insulin-like growth factor signaling as a hallmark of aging in developing B cells

著者 (32件)： Koohy Hashem (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Koohy Hashem (Human Immunology Unit, MRC Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Bolland Daniel J. (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Bolland Daniel J. (Laboratory of Lymphocyte Signalling and Development, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Matheson Louise S. (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Matheson Louise S. (Laboratory of Lymphocyte Signalling and Development, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Schoenfelder Stefan (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Stellato Claudia (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Dimond Andrew (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Varnai Csilla (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Chovanec Peter (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Chovanec Peter (Laboratory of Lymphocyte Signalling and Development, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Chessa Tamara (Signalling, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Denizot Jeremy (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Denizot Jeremy (Present address: Universite Clermont Auvergne, Inserm U1071, M2iSH, USC-INRA 2018, Clermont-Ferrand, France) ,  Garcia Raquel Manzano (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Wingett Steven W. (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Wingett Steven W. (Bioinformatics, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Freire-Pritchett Paula (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Freire-Pritchett Paula (Division of Cell Biology, Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK) ,  Nagano Takashi (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Hawkins Phillip (Signalling, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Stephens Len (Signalling, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Elderkin Sarah (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Spivakov Mikhail (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Spivakov Mikhail (Functional Gene Control Group, MRC London Institute of Medical Sciences (LMS), London, UK) ,  Fraser Peter (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Fraser Peter (Department of Biological Science, Florida State University, FL, USA) ,  Corcoran Anne E. (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Corcoran Anne E. (Laboratory of Lymphocyte Signalling and Development, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Varga-Weisz Patrick D. (Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge, UK) ,  Varga-Weisz Patrick D. (School of Biological Sciences, University of Essex, Colchester, UK)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 126  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 加齢は適応免疫系の機能の喪失により特徴付けられるが,基礎となる原因はあまり理解されていない。B細胞発生に及ぼす老化の分子効果を評価するために,若いマウスと老化したマウスの骨髄プロBとプレB細胞において,ヒストン修飾と染色体立体配座を含む遺伝子発現とクロマチンの特徴を調べた。著者らの分析は,ほとんどの遺伝子の発現レベルが,若いマウスと比較して老齢から分離されたB細胞前駆体において一般的に保存されていることを明らかにする。それにもかかわらず,年齢特異的発現変化は,マイクロRNAコード遺伝子を含む多数の遺伝子で観察される。重要なことに,これらの変化は,クロマチンの接近性,ヒストン修飾,長距離プロモーター相互作用,および核区画化を含むクロマチン構造の多層変化により支えられている。以前の研究は,分化がプロモーター調節要素相互作用の変化と関連していることを示している。B細胞前駆体のエージングはこのような相互作用の再配線を伴うことを見出した。加齢表現型の特徴として,インシュリン様成長因子シグナル伝達経路の成分の転写ダウンレギュレーション,特にIrs1のダウンレギュレーション及びLet-7マイクロRNA発現のアップレギュレーションを同定した。発現におけるこれらの変化はH3K27me3占有の特異的変化と関連しており,ポリコーム仲介抑制が前駆体B細胞老化において役割を果たしていることを示唆した。クロマチンと3Dゲノム組織の変化は,老化した前駆体B細胞の遺伝子発現プロファイルの変化に重要な役割を果たしている。インシュリン様成長因子シグナル伝達経路の成分は,骨髄B細胞前駆体における老化における後成的調節の重要な標的である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 前駆体 ,  プロモーター領域 ,  アップレギュレーション ,  *ダウンレギュレーション ,  立体配座 ,  遺伝子発現 ,  三次元 ,  相互作用 ,  骨髄 ,  染色体 ,  老化 ,  *クロマチン ,  表現型
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  ヒストン修飾 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (87件)：

• Nikolich-Žugich J. The twilight of immunity: emerging concepts in aging of the immune system. Nat Immunol. 2018;19:10-9.
• EMBO J.; The interleukin-7 receptor alpha chain transmits distinct signals for proliferation and differentiation during B lymphopoiesis; AE Corcoran, FM Smart, RJ Cowling, T Crompton, MJ Owen, AR Venkitaraman; 15; 1996; 1924-1932; 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00543.x; citation_id=CR2
• Blood; Insulin-like growth factor-1 potentiates expansion of interleukin-7-dependent pro-B cells; LF Gibson, D Piktel, KS Landreth; 82; 1993; 3005-3011; citation_id=CR3
• Eur J Immunol.; Both the pre-BCR and the IL-7Ralpha are essential for expansion at the pre-BII cell stage in vivo; L Erlandsson, S Licence, F Gaspal, P Lane, AE Corcoran, I-L Mårtensson; 35; 2005; 1969-1976; 10.1002/eji.200425821; citation_id=CR4
• Nat Rev Immunol.; Orchestrating B cell lymphopoiesis through interplay of IL-7 receptor and pre-B cell receptor signalling; MR Clark, M Mandal, K Ochiai, H Singh; 14; 2014; 69-80; 10.1038/nri3570; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： ゲノム構成 ,  クロマチン ,  分析 ,  B細胞 ,  加齢 ,  インシュリン様成長因子 ,  シグナル伝達 ,  転写 ,  ダウンレギュレーション ,  同定