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J-GLOBAL ID：201902263802952552   整理番号：19A0660247

ラウンドロビン研究:内部自由度モデルからの熱力学的性質の分子シミュレーション【JST・京大機械翻訳】

Round Robin Study: Molecular Simulation of Thermodynamic Properties from Models with Internal Degrees of Freedom

著者 (15件)： Schappals Michael (Laboratory of Engineering Thermodynamics (LTD), University of Kaiserslautern, Germany) ,  Mecklenfeld Andreas (Institut fuer Thermodynamik (ift), Technische Universitaet Braunschweig, Germany) ,  Kroeger Leif (Lehrstuhl fuer Technische Thermodynamik (LTT), RWTH Aachen University, Germany) ,  Botan Vitalie (Lehrstuhl fuer Technische Thermodynamik (LTT), RWTH Aachen University, Germany) ,  Koester Andreas (Thermodynamics and Energy Technology (ThEt), University of Paderborn, Germany) ,  Stephan Simon (Laboratory of Engineering Thermodynamics (LTD), University of Kaiserslautern, Germany) ,  Garcia Edder J. (Laboratory of Engineering Thermodynamics (LTD), University of Kaiserslautern, Germany) ,  Rutkai Gabor (Thermodynamics and Energy Technology (ThEt), University of Paderborn, Germany) ,  Raabe Gabriele (Institut fuer Thermodynamik (ift), Technische Universitaet Braunschweig, Germany) ,  Klein Peter (Fraunhofer Institute for Industrial Mathematics (ITWM), Germany) ,  Leonhard Kai (Lehrstuhl fuer Technische Thermodynamik (LTT), RWTH Aachen University, Germany) ,  Glass Colin W. (High Performance Computing Center (HLRS), Germany) ,  Lenhard Johannes (Department of Philosophy, Bielefeld University, Germany) ,  Vrabec Jadran (Thermodynamics and Energy Technology (ThEt), University of Paderborn, Germany) ,  Hasse Hans (Laboratory of Engineering Thermodynamics (LTD), University of Kaiserslautern, Germany)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 9  ページ： 4270-4280  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 熱力学的性質は,原子スケールでの相互作用を記述する古典的力場によってしばしばモデル化される。そのようなモデルから熱力学データを検索するために分子シミュレーションを用い,多くのシミュレーション技術と計算機コードがその目的のために利用可能である。現在のラウンドロビン研究において,以下の基本的な問題に取り組んだ。異なるシミュレーションコードで動作する異なるユーザグループは,それらのデータの統計的不確実性の範囲内で一致する結果を得た。24の簡単なシミュレーション作業のセットを定義し,8つの分子シミュレーションコード,すなわち,dl_POLY,GROMACS,IMC,LAMMPS,ms2,NAMD,Tinker,およびToheeにより動作する5つのユーザグループにより解いた。各作業は,(1)力の場によって記述される純粋な流体と(2)特性が決定される条件の定義から成る。流体は4つの単純アルカン:エタン,プロパン,n-ブタン及びイソブタンである。全ての力の場は内部自由度:OPLS,TraPPE,及び結合伸縮振動を伴う修正OPLSバージョンを考慮した。密度とポテンシャルエネルギーは,すべての状態が液体であるように特定された格子上の温度と圧力の関数として決定される。ユーザグループは独立に動作し,それらの結果を中心事例に報告した。結果の完全なセットは,研究の終わりにおいてのみ,すべてのユーザグループに開示された。研究の間,中心例は定性的フィードバックのみを与えた。結果は,分子シミュレーションを行うことの挑戦を明らかにした。総誤差を除去するために,いくつかの反復が必要であった。ほとんどのシミュレーションタスクに対して,異なるグループの結果の間の残りの偏差は実用的な観点から許容できるが,それらは個々のシミュレーションデータの統計誤差の外側にあることが多い。しかし,偏差が許容できない場合もある。本研究は,統計的誤差だけでなく系統的誤差に対しても,計算機実験と実験室実験の間の類似性を強調した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *シミュレーション ,  計算機コード ,  相互作用 ,  アルカン ,  計算機シミュレーション ,  力の場 ,  モデリング ,  ポテンシャルエネルギー ,  不確実性 ,  *モデル
準シソーラス用語： *分子シミュレーション ,  *ラウンドロビン , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (3件)： イソブタン ,  プロパン ,  エタン

タイトルに関連する用語 (6件)： ラウンドロビン ,  研究 ,  内部自由度 ,  モデル ,  熱力学的性質 ,  分子シミュレーション