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J-GLOBAL ID：201902263972841208   整理番号：19A2448417

遺伝子共発現解析はヒト肺腺癌の重要なモジュールと経路を提供する【JST・京大機械翻訳】

Gene coexpression analysis offers important modules and pathway of human lung adenocarcinomas

著者 (6件)： Wei Zhongheng (Department of Oncology, Affiliated Hospital of Youjiang Medical University for Nationalities, Baise, Guangxi, China) ,  Zhongqiu Tan (Department of Oncology, Affiliated Hospital of Youjiang Medical University for Nationalities, Baise, Guangxi, China) ,  Lu Shuxiong (Department of Pathology, Huai’an Maternal and Child Health Care Center of Jiangsu Province Affiliated Hospital of Yangzhou University, Huai’an, China) ,  Zhang Fang (School of Medicine, Fudan University, Shanghai, China) ,  Xie Wei (Department of Radiology, Central Hospital of Wuhan, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Wang Ying (Respiratory Medicine Department, The First People’s Hospital of Tianmen, Tianmen, Hubei, China)
資料名： Journal of Cellular Physiology  (Journal of Cellular Physiology)
巻： 235  号： 1  ページ： 454-464  発行年： 2020年 
JST資料番号： E0042B  ISSN： 0021-9541  CODEN： JCLLA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肺腺癌は世界中で大きく損傷した。臨床実験と遺伝子プロファイリング分析は良く行われているが,著者らの知る限り,この癌に対するヒト遺伝子の全身共発現分析は今まで限られている。ここでは,公表されたデータGSE75037を用いて,著者らは,加重遺伝子共発現ネットワーク分析(WGCNA)によって遺伝子の共発現モジュールを構築し,それぞれ,アノテーション,可視化および統合Discovery(DAVID)およびStringデータベースに対するデータベースによって共発現遺伝子の機能および蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを調査した。最初に,11の共発現モジュールは,最近83のサンプルにおいて,5000の遺伝子のために実施した。各モジュールの遺伝子数は90~1,260の範囲で,平均は454であった。第二に,ペアワイズモジュール間のハブ遺伝子の相互作用関係は大きな違いを示し,モジュールの比較的高いスケール独立性を示唆した。第3に,共発現モジュールの機能的濃縮は大きな差を示した。モジュール8の遺伝子は,細胞接着,細胞外マトリックス(ECM)-受容体相互作用,焦点接着およびPI3K-Aktシグナル伝達経路などの生物学的過程および/または経路において有意に濃縮されていることを見出した。それは肺腺癌の基礎となる重要なモジュールとして推論された。さらに,PPI分析により,遺伝子COL1A1,COL1A2,COL3A1,CTGF,およびBGNは,肺腺癌の発生の間に重要な機能を果たす可能性がある最も多くの隣接遺伝子を所有していることが明らかになった。要約すると,細胞接着,ECM-受容体相互作用,焦点接着,およびPI3K-Aktシグナル伝達経路に関与する遺伝子は,ヒト肺腺癌において重要な役割を果たす。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  可視化 ,  細胞接着 ,  相互作用 ,  *ヒト ,  アノテーション ,  受容体 ,  *遺伝子 ,  データベース ,  細胞外マトリックス
準シソーラス用語： 伝達経路 ,  Akt/蛋白質キナーゼB ,  *共発現 ,  プロファイリング ,  *肺腺癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 共発現モジュール ,  機能 ,  肺腺癌 ,  ネットワーク

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 遺伝子 ,  共発現 ,  解析 ,  ヒト ,  肺腺癌 ,  モジュール ,  経路