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J-GLOBAL ID：201902264426746184   整理番号：19A0494579

ゲノムワイド解析はStreptomyces kanasensis ZX01における二次メタボロームを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Analysis Reveals the Secondary Metabolome in Streptomyces kanasensis ZX01

著者 (7件)： Zhang Guoqiang (Research & Development Center of Biorational Pesticide, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi, China) ,  Zhang Guoqiang (College of Agriculture, Shihezi University, Shihezi 832000, Xinjiang, China) ,  Yu Dailin (Agriculture Research institute, Tibet Academy of Agricultural and animal Husbandry Science, Lhasa 850032, Tibet, China) ,  Sang Bu (Agriculture Research institute, Tibet Academy of Agricultural and animal Husbandry Science, Lhasa 850032, Tibet, China) ,  Feng Juntao (Research & Development Center of Biorational Pesticide, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi, China) ,  Han Lirong (Research & Development Center of Biorational Pesticide, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi, China) ,  Zhang Xing (Research & Development Center of Biorational Pesticide, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 12  ページ： 346  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Streptomyces kanasensis ZX01は抗ウイルス活性を有するいくつかの抗生物質と糖蛋白質を産生する。さらに,その生合成可能性を評価するために,S.kanasensis ZX01の7,026,279bpドラフトゲノムを配列し,天然産物を制御するためのすべての同定可能な二次遺伝子クラスタを分析した。S.kanasensis ZX01において60以上の推定クラスタが見出され,これらの生合成遺伝子座の大部分は新規である。加えて,S.kanasensis ZX01における二次代謝の調節因子は豊富であった。全体的調節因子nsdAは,いくつかの抗生物質の生合成を制御するだけでなく,抗ウイルス活性を有する糖蛋白質GP-1の産生を強化する。本研究は,ゲノム解析と伝統的な天然物精製/生産の研究の間の強力な相互作用を明らかにした。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ ,  相互作用 ,  *ゲノム ,  *Streptomyces ,  抗生物質 ,  生合成 ,  天然材料 ,  抗ウイルス作用 ,  糖タンパク質
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  調節因子 ,  二次代謝 ,  生合成遺伝子 ,  遺伝子クラスタ ,  *メタボローム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ゲノムマイニング ,  二次代謝 ,  NSDA ,  レギュレータ ,  糖蛋白質gp-1

分類 (2件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (28件)：

• Bentley, S.; Chater, K.; Cerdeno-Tarraga, A.M.; Challis, G.; Thomson, N.; James, K.; Harris, D.; Quail, M.; Kieser, H.; Harper, D. Complete genome sequence of the model actinomycete Streptomyces coelicolor A3(2). Nature 2002, 417, 141-147.
• Zazopoulos, E.; Huang, K.; Staffa, A.; Liu, W.; Bachmann, B.O.; Nonaka, K.; Ahlert, J.; Thorson, J.S.; Shen, B.; Farnet, C.M. A genomics-guided approach for discovering and expressing cryptic metabolic pathways. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 187-190.
• Udwary, D.W.; Zeigler, L.; Asolkar, R.N.; Singan, V.; Lapidus, A.; Fenical, W.; Jensen, P.R.; Moore, B.S. Genome sequencing reveals complex secondary metabolome in the marine actinomycete Salinispora tropica. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 10376-10381.
• Liu, G.; Chater, K.F.; Chandra, G.; Niu, G.; Tan, H. Molecular regulation of antibiotic biosynthesis in Streptomyces. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2013, 77, 112-143.
• Han, L.; Zhang, G.; Miao, G.; Zhang, X.; Feng, J. Streptomyces kanasensis sp. nov., an antiviral glycoprotein producing actinomycete isolated from forest soil around Kanas lake of china. Curr. Microbiol. 2015, 71, 627-631.

タイトルに関連する用語 (4件)： ゲノム ,  解析 ,  Streptomyces ,  メタボローム