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J-GLOBAL ID：201902264598446433   整理番号：19A0494591

snoRD116遺伝子座の系統発生解析【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic Analysis of the SNORD116 Locus

著者 (3件)： Kocher Matthew A. (Translational Biology, Medicine and Health Graduate Program, Virginia Tech, Blacksburg, VA 24061, USA) ,  Good Deborah J. (Translational Biology, Medicine and Health Graduate Program, Virginia Tech, Blacksburg, VA 24061, USA) ,  Good Deborah J. (Department of Human Nutrition, Foods, and Exercise, Virginia Tech, Blacksburg, VA 24061, USA)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 12  ページ： 358  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SNORD116小核小体RNA遺伝子座(SNORD116@)は,ヒト染色体15q11-q13上の長い非コードRNA宿主遺伝子SNHG14内に含まれている。SNORD116遺伝子座は,28以上の小核小体(sno)RNAのクラスターである。C/Dボックス(SNORDs)。クラスタ内の個々のRNAは,SNORD116@と呼ばれる全セットを持つSNORD116-1,SNORD116-2などと呼ばれるタンデムで高度に類似した配列である。他の染色体上のSNORD116遺伝子座も関連しており,これらの付加的遺伝子座は霊長類間で保存されている。SNORD116@遺伝子座を網羅する遺伝性染色体15q11-q13欠失は,父性遺伝的/母性的に刷込まれた遺伝的状態,Prader-Willi症候群(PWS)の原因である。in silicoツールを用いて,分子ベースおよび配列ベースの確認とともに,SNORD116@遺伝子座の系統発生分析を行った。種々の種からのSNORD116@snoRNAに対するコンセンサス配列を,全てのSNORD116snoRNAについて,また,ヒトのグループ化規約に従って配列と位置を用いてグループ化したものと同様に決定した。これらの知見の意味を,遺伝性Prader-Willi症候群患者およびモデル生物におけるSNORD116の研究のために展望した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 霊長類 ,  染色体 ,  性染色体 ,  *系統発生 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  クラスタ ,  ヒト ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： コンセンサス配列 ,  snoRNA ,  系統解析 ,  in silico ,  父性遺伝 ,  非翻訳RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Prader-Willi症候群 ,  SNORNA ,  系統発生解析 ,  インプリンティング

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  先天性疾患・奇形一般  (GD03010V) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

引用文献 (25件)：

• Levene, P.A.; Jacobs, W.A. Über inosinsäure. Eur. J. Inorg. Chem. 1909, 42, 1198-1203.
• Gros, F.; Gilbert, W.; Hiatt, H.H.; Attardi, G.; Spahr, P.F.; Watson, J.D. Molecular and biological characterization of messenger RNA. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 1961, 26, 111-132.
• Carninci, P.; Kasukawa, T.; Katayama, S.; Gough, J.; Frith, M.C.; Maeda, N.; Oyama, R.; Ravasi, T.; Lenhard, B.; Wells, C.; et al. The transcriptional landscape of the mammalian genome. Science 2005, 309, 1559-1563.
• Ensemble Consortium; Birney, E.; Stamatoyannopoulos, J.A.; Dutta, A.; Guigo, R.; Gingeras, T.R.; Margulies, E.H.; Weng, Z.; Snyder, M.; Dermitzakis, E.T.; et al. Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the encode pilot project. Nature 2007, 447, 799-816.
• Pennisi, E. Genomics. ENCODE project writes eulogy for junk DNA. Science 2012, 337, 1159, 1161.

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子座 ,  系統発生 ,  解析