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J-GLOBAL ID：201902264605664263   整理番号：19A1478091

オオムギ種子のCaryopsisに対する殻の付着に関するゲノムワイド関連分析への階層的アプローチは選択の足跡を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

A tiered approach to genome-wide association analysis for the adherence of hulls to the caryopsis of barley seeds reveals footprints of selection

著者 (7件)： Wabila Celestine (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Seeland, Germany) ,  Neumann Kerstin (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Seeland, Germany) ,  Kilian Benjamin (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Seeland, Germany) ,  Kilian Benjamin (Present address: Global Crop Diversity Trust, Platz der Vereinten Nationen 7, Bonn, Germany) ,  Radchuk Volodymyr (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Seeland, Germany) ,  Graner Andreas (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Seeland, Germany) ,  Graner Andreas (Martin-Luther-University Halle-Wittenberg, Halle/Saale, Germany)
資料名： BMC Plant Biology (Web)  (BMC Plant Biology (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 95  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7027A  ISSN： 1471-2229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 栽培されたオオムギの種子は,形態が異なる2つの異なるタイプに分類される。成熟期の果皮に強固に付着する向軸性(palea)および背軸性(鞘)殻により覆われたコイは,外皮種子を生み出し,一方,外皮を付着させないコイは,裸の種子を生じる。裸のカリオフィレン特性はオオムギの最終利用に関する必須の特性である。形質の遺伝的基礎を明らかにするために,2222-rowedおよび3036-rowed春オオムギ在来種系統を含むパネルにおいて,ゲノムワイド関連研究(GWAS)を実施した。染色体7H上の良く記述されたNud遺伝子座に加えて,3つの新規遺伝子座は形質と強い関連性を示した。2H上の最初の遺伝子座は特異的に6回転系統で検出され,3H上の2番目の遺伝子座はユーラシアからの2つの遺伝子座で見出され,6つの遺伝子座はエチオピアからの6つの輪作系統で明らかにされた。また,裸の系統のPCR分析により,すべてについて染色体7H上のNud遺伝子を含む17kb領域の不在が確認された。後者はcaryopsisのわずかに変異した表現型により特徴付けられた。著者らの知見は,異なる地理的領域からの春オオムギにおける17kb欠失の説得性の証拠を提供し,同時に,地理的および形態学的パターンの両方に従う裸オオムギにおける選択のゲノムフットプリントを明らかにした。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 表現型 ,  地理学 ,  遺伝 ,  *オオムギ ,  ゲノムワイド関連解析 ,  果皮 ,  遺伝子 ,  エチオピア連邦民主共和国 ,  在来種 ,  *ゲノム ,  ロバスト性
準シソーラス用語： フットプリント ,  ユーラシア ,  春大麦 ,  外皮系 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： GWAS ,  裸のCaryopsis ,  NUD ,  家畜化 ,  種子蛋白質含量

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (42件)：

• Zohary, D., M. Hopf, and E. Weiss, Domestication of Plants in the Old World. (Fourth Edition)Oxford University Press (2013), 2013.
• Mol Biol Evol; On the origin and domestication history of barley (Hordeum vulgare); A Badr; 17; 4; 2000; 499-510; 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026330; citation_id=CR2
• Antiquity; DNA evidence for multiple introductions of barley into Europe following dispersed domestications in Western Asia; G Jones; 87; 337; 2013; 701-713; 10.1017/S0003598X00049401; citation_id=CR3
• Poets AM, et al. Barley landraces are characterized by geographically heterogeneous genomic origins. Genome Biol. 2015;16.
• The New Phytologist; Targeted resequencing reveals genomic signatures of barley domestication; A Pankin; 218; 3; 2018; 1247-1259; 10.1111/nph.15077; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： オオムギ ,  種子 ,  殻 ,  ゲノム ,  分析 ,  足跡