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J-GLOBAL ID：201902265485803054   整理番号：19A0659981

リボヌクレアーゼAの熱変性におけるジスルフィド結合破壊と形成の動力学【JST・京大機械翻訳】

Dynamics of Disulfide-Bond Disruption and Formation in the Thermal Unfolding of Ribonuclease A

著者 (6件)： Krupa Pawel (Baker Laboratory of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, New York, United States) ,  Sieradzan Adam K. (Faculty of Chemistry, University of Gdansk, Poland) ,  Mozolewska Magdalena A. (Baker Laboratory of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, New York, United States) ,  Li Huiyu (Baker Laboratory of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, New York, United States) ,  Liwo Adam (Faculty of Chemistry, University of Gdansk, Poland) ,  Scheraga Harold A. (Baker Laboratory of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, New York, United States)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 11  ページ： 5721-5730  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： リボヌクレアーゼA(RNアーゼA)は,RNA分解を触媒する酵素のグループであるリボヌクレアーゼの最も研究されたメンバーである。RNアーゼAは4つのジスルフィド結合を含み,蛋白質の天然構造に必要であることが分かった。本研究では,RNアーゼ非折畳みの速度論と熱力学を,一連の粗粒正準分子動力学シミュレーション,種々の温度での実行,およびシミュレーション過程でのジスルフィド結合の動的形成と破壊を可能にするUNRES力場によるレプリカ交換分子動力学シミュレーションにより研究した。Cys40-Cys95結合は最初に切断されたが,Cys26-Cys84結合は温度に依存せず,利用可能な実験データと一致した。Cys40-Cys95結合を除いて,全てのジスルフィド結合はシミュレーション中に比較的安定であった。ジスルフィド結合の形成/破壊は,Cys65とCys72の間の最も安定なジスルフィド結合を除いて,RNアーゼAにおける4つのジスルフィド結合のうちの3つに対して温度依存性であることが分かった。Cys40-Cys95ジスルフィド結合のない安定な中間体は,実験的に観察された最も一般的な折畳み中間体の構造と類似した構造を有し,シミュレートされた変性において見出された。実験と一致して,非天然ジスルフィド結合も観察された。残基位置の変動を分析することにより,天然ジスルフィド結合が蛋白質の高度に柔軟な領域に位置し,おそらくそれらの存在がRNアーゼAの安定性に必要である理由であることが分かった。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNアーゼA ,  触媒 ,  力の場 ,  熱力学 ,  *RNアーゼ ,  温度依存性 ,  タンパク質 ,  デコンボリューション ,  中間体 ,  シミュレーション ,  *ジスルフィド結合 ,  計算機シミュレーション ,  *熱変性 ,  速度論
準シソーラス用語： 残基 ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  理論生物学一般  (EA02010D) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

タイトルに関連する用語 (5件)： リボヌクレアーゼA ,  熱変性 ,  ジスルフィド結合 ,  破壊 ,  動力学