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J-GLOBAL ID：201902265765580792   整理番号：19A2235799

位相コントラスト顕微鏡画像における酵母細胞追跡のためのGPUアルゴリズム【JST・京大機械翻訳】

A GPU algorithm for tracking yeast cells in phase-contrast microscopy images

著者 (5件)： Rea Domenico (University of Naples Parthenope, Naples, Italy) ,  Perrino Giansimone (Telethon Institute of Genetics and Medicine, Pozzuoli (Naples), Italy) ,  di Bernardo Diego (Telethon Institute of Genetics and Medicine, Pozzuoli (Naples), Italy) ,  Marcellino Livia (University of Naples Parthenope, Naples, Italy) ,  Romano Diego (Institute for High Performance Computing and Networking (ICAR), Italian National Research Council (CNR), Naples, Italy)
資料名： International Journal of High Performance Computing Applications  (International Journal of High Performance Computing Applications)
巻： 33  号： 4  ページ： 651-659  発行年： 2019年 
JST資料番号： T0485A  ISSN： 1094-3420  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 顕微鏡画像のシーケンスから得られた情報と測度が時間制約を受けるとき,適切な高速アルゴリズムは,全体のデータセットを処理するために実行されなければならない。本研究では,時間経過観察から得られた画像列を処理し,時間をかけてマイクロ流体チップにおける単一酵母細胞を検出した。基礎となるアイデアは,線形計画法(LP)問題を設定し,解くことにより表現できる,各対のフレームに対する最小コスト構成を決定することにある。研究所は,そのような意図のためにHPCハードウェアを使用する機会をほとんど持っていない。この理由のために,CUDAに実装された効率的なGPU並列ソフトウェアを提案し,LP問題を解決するための一般的なツールであるシンプレックス法に基づいている。この並列戦略は,全体スループットを最大化するために,スレッド発散を最小化し,デバイス占有率を最大化する。また,データの局所性を利用するために,ホストとデバイス間のメモリ転送を最小化した。実画像列に関する実験結果は,実時間応用に適したCPUバージョンに関して有望な高速化を強調した。Copyright The Author(s) 2018 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： スレッド ,  ソフトウェア ,  測度 ,  高速化 ,  *アルゴリズム ,  占有率 ,  シンプレックス法 ,  記憶装置 ,  スループット ,  ハードウェア ,  局所性 ,  *酵母 ,  高速アルゴリズム
準シソーラス用語： 画像列 ,  *顕微鏡画像 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 位相コントラスト顕微鏡法 ,  GPUコンピューティング ,  細胞追跡 ,  CUDA ,  シンプレックス法

分類 (2件)： 産業排ガス処理  (SC04040S) ,  排ガス処理  (PB02060U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 位相コントラスト ,  顕微鏡画像 ,  酵母 ,  細胞追跡 ,  GPU ,  アルゴリズム