ビタミンD(1,25-(OH)_2D_3)は高グルコース処理内皮前駆細胞における競合内因性RNAネットワークを介して遺伝子発現を調節する【JST・京大機械翻訳】

Yu Ping; Yu Ping; Song Haiyan; Gao Jiaxin; Li Bo; Liu Ying; Wang Yanhe; Wang Yanhe

文献

J-GLOBAL ID：201902266318095321 整理番号：19A2213459

ビタミンD(1,25-(OH)_2D_3)は高グルコース処理内皮前駆細胞における競合内因性RNAネットワークを介して遺伝子発現を調節する【JST・京大機械翻訳】

Vitamin D (1,25-(OH)₂D₃) regulates the gene expression through competing endogenous RNAs networks in high glucose-treated endothelial progenitor cells

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資料名：
巻： 193 ページ： Null 発行年： 2019年
JST資料番号： C0595A ISSN： 0960-0760 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

ビタミンD(Vit-D)補給は,Vit-D不全または欠損を有する2型糖尿病患者における内皮細胞機能を改善することができる。本研究では,1,25-(OH)_2D_3処理内皮前駆細胞(EPCs)と対照細胞の間のcircRNA,lncRNA,miRNA,およびmRNAの発現プロファイルを比較し,EPCsにおける1,25-(OH)_2D_3制御ceRNAネットワークをさらに構築することを目的とした。RNA塩基配列決定は,1,25-(OH)_2D_3処理EPCsおよび骨髄(BM)由来の対照細胞で行った。バイオインフォマティクス分析を行い,異なる発現(DE)マイクロRNA(miRNA),円形RNA(circRNA),mRNA,および長い非コードRNA(lncRNA)を同定した。遺伝子の機能を予測するために,遺伝子オントロジー(GO)とGenおよびゲノム(KEGG)濃縮分析を行った。競合する内在性RNA(ceRNA)ネットワークを,Cytosecapeソフトウェアで構築した。1,25-(OH)_2D_3適用は,高レベルのグルコースで処理されたEPCsにおいて,1791mRNA,2726lncRNA,205circRNA,および45miRNAの発現プロファイルの変化を誘発した。これらのDE RNAは,MMPおよびGTPアーゼ活性,特異的シグナル伝達経路,およびアクチン,細胞外マトリックスまたは接着結合の成分と関連していた。それらの線形宿主遺伝子と独立して機能するde circRNAは,複雑なceRNAネットワークにおけるmiRNAスポンジとして機能するmiRNAと相互作用した。データは,circRNAとlncRNAが,EPCsにおける1,25-(OH)_2D_3適用後のmRNA発現に及ぼすmiRNAのスポンジ効果に対するceRNAを構成することを示した。1,25-(OH)_2D_3は,糖尿病患者における関連したceRNA相互作用ネットワークを介してEPCsの機能を改善した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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ビタミンD

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