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J-GLOBAL ID：201902266858128096   整理番号：19A2048973

機能的遺伝子セット濃縮分析に基づく新生児Sepsisの潜在的遺伝子と経路【JST・京大機械翻訳】

Potential Genes and Pathways of Neonatal Sepsis Based on Functional Gene Set Enrichment Analyses

著者 (3件)： Meng YuXiu ( Department of Neonatology, First People’s Hospital of Jining, Jining, Shandong 272000, China) ,  Cai Xue Hong ( Department of Pediatrics, Traditional Chinese Medicine Hospital of Yanzhou, Jining, Shandong 272100, China) ,  Wang LiPei ( Department of Neonatology, First People’s Hospital of Jining, Jining, Shandong 272000, China)
資料名： Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web)  (Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web))
巻： 2018  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7693A  ISSN： 1748-670X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.新生児敗血症(NS)は新生児が罹患する新生児死亡の最も一般的な原因と考えられている。多くの研究がNSの遺伝子バイオマーカーに焦点を当てているが,遺伝子バイオマーカーの予測値は低い。NS病因は,まだ調査する必要がある。方法:データ前処理後,KEGG濃縮法を用いて,NSと正常対照の間の差次的に発現した経路を同定した。次に,機能的主成分分析(FPCA)を,NSにおける遺伝子値を計算するために採用した。NSの重要なシグナル伝達経路をさらに研究するために,弾性ネット回帰モデル,マン-ホイットニーU試験,および共発現ネットワークを用いて,シグナル伝達経路およびハブ遺伝子の重みを推定した。結果:NSと対照の間の合計115の異なる経路を最初に同定した。FPCAは時系列遺伝子発現情報を完全に利用し,異なる経路における遺伝子のF値を推定した。上部1000遺伝子を異なる遺伝子とみなし,さらに弾性ネット回帰とMWU試験により分析した。異なるソースに従って,NSと対照の間に7つの重要なシグナル伝達経路があった。重要な経路に関与するそれらの遺伝子の中で,7つのハブ遺伝子,PIK3CA,TGFBR2,CDKN1B,KRAS,E2F3,TRAF6,およびCHUKを共発現ネットワークに基づいて決定した。それらのほとんどは癌関連遺伝子であった。PIK3CAはリンパ球群で高度に発現する共通マーカーと考えられた。NSによるPIK3CAの相関についてはほとんど知られておらず,NS研究に対する新しい啓蒙を与える。結論.本研究は,NS治療標的としての潜在的新規遺伝子および経路を調査するための展望情報を提供する可能性がある。Copyright 2018 YuXiu Meng et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *新生児 ,  ネットワーク ,  病因 ,  主成分分析 ,  バイオマーカー ,  遺伝子発現 ,  回帰モデル ,  リンパ球 ,  弾性 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： F値 ,  共発現 ,  伝達経路 ,  予測値 ,  新生児敗血症 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (39件)：

• S. Skibsted, A. E. Jones, M. A. Puskarich et al., "Biomarkers of endothelial cell activation in early sepsis," Shock, vol. 39, no. 5, pp. 427-432, 2013.
• J. Song, D. Hu, C. He et al., "Novel biomarkers for early prediction of sepsis-induced disseminated intravascular coagulation in a mouse cecal ligation and puncture model," Journal of Inflammation, vol. 10, no. 1, pp. 7, 2013.
• D. Jrovsky, I. C. Marchetti, M. A. da Silva Mori et al., "Early-onset neonatal pneumococcal sepsis: a fatal case report and brief literature review," Pediatric Infectious Disease Journal, vol. 37, no. 4, pp. e111-e112, 2017.
• A. Abbas, I. Ahmad, "First report of neonatal early-onset sepsis caused by multi-drug-resistant Raoultella ornithinolytica," Infection, vol. 46, no. 2, pp. 275-277, 2017.
• W. van Herk, S. el Helou, J. Janota et al., "Variation in current management of term and late-preterm neonates at risk for early-onset sepsis: an international survey and review of guidelines," Pediatric Infectious Disease Journal, vol. 35, no. 5, pp. 494-500, 2016.

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝子 ,  濃縮 ,  分析 ,  新生児 ,  経路